| 阜阳市手足口病柯萨奇病毒A10型VP4区基因特征分析 |
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| 引用本文： | 赵蕾,陈敬贤,王明丽.阜阳市手足口病柯萨奇病毒A10型VP4区基因特征分析[J].中华疾病控制杂志,2013,17(6):480-483. |
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| 作者姓名： | 赵蕾 陈敬贤 王明丽 |
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| 作者单位： | 1. 安徽医科大学基础医学院微生物学教研室,安徽合肥,230032
2. 安徽医科大学基础医学院微生物学教研室,安徽合肥230032;哥伦比亚大学病理与细胞生物学教研室美国纽约10032 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，安徽省科技厅科技攻关项目 |
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| 摘 要： | 目的分析2011-2012年阜阳市手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)患儿咽拭子标本分离的柯萨奇病毒A10型(coxsackievirus A10,CoxA10)VP4区的基因特征,初步了解该病毒的变异情况。方法对49份HFMD患儿的咽拭子标本进行病毒分离,出现人肠道病毒(human enterovirus,HEV)特征性病毒致细胞病变效应(cytopathic effect,CPE)后提取病毒RNA,用VP4区分型引物进行半巢式反转录-PCR,再通过测序和GenBank Blast比对确定病毒型别,并对其VP4区进行序列进化分析。结果 49份咽拭子标本有16份出现了特征性CPE,病毒分离阳性率32.7%。其中三株经鉴定为CoxA10,阳性率18.8%。它们的VP4区核苷酸序列同源性为95%～99%,与GenBank中参考毒株VP4区核苷酸序列同源性为77%～97%。其中与中国株HQOO5431同源性为96%～97%,与中国株JN639887同源性为96%～97%,与中国株FJ598089同源性为95%～96%,与日本株AB282808同源性为85%～86%,与日本株AB162743同源性为87%～89%,与CoxA10原型株Kowalik(AF081300)同源性为77%～78%。进化分析表明这三株分离株与Kowalik株聚成一簇,均属于CoxA10,与日本各地分离的CoxA10的病毒核苷酸差异较大,但与我国本土分离株自成一簇。结论 2011-2012年阜阳地区手足口病病原体CoxA10 VP4与中国地区分离株在进化上密切相关,其序列未发生明显变异。
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| 关 键 词： | 手足口病 柯萨奇病毒感染 序列同源性 |
Gene characteristics analysis for CoxA10 VP4 region of hand-foot-mouth disease in Fuyang |
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| ZHAO Lei,CHEN Jing-xian,WANG Ming-li.Gene characteristics analysis for CoxA10 VP4 region of hand-foot-mouth disease in Fuyang[J].Chinese Journal of Disease Control & Prevention,2013,17(6):480-483. |
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| Authors: | ZHAO Lei CHEN Jing-xian WANG Ming-li |
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| Institution: | 1.1.Department of Microbiology,Basic Medical College,Anhui Medical University,Hefei 230032,China;2.Department of Cell Biology and Pathology,Columbia University,New York 10032,America |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hand foot and mouth disease Coxsackievirus infections Sequence homology |
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