广西禽流感H5N1亚型病毒HA基因序列分析 |
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引用本文: | 闭福银,谭毅,陈敏玫,何为涛,莫毅,谢镇国.广西禽流感H5N1亚型病毒HA基因序列分析[J].应用预防医学,2013,0(2):65-68. |
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作者姓名: | 闭福银 谭毅 陈敏玫 何为涛 莫毅 谢镇国 |
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作者单位: | 广西壮族自治区疾病预防控制中心 南宁 530028 |
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摘 要: | 目的了解广西禽流感H5N1亚型病毒的基因特性.方法2011年在广西农贸市场采集污水、笼具涂抹、粪便标本,经H5亚型特异实时荧光定量PCR方法(Real-time fluorescence quantitative RT-PCR)检测,阳性样本进行病毒血凝素(hemagglutinin,HA)基因扩增后对产物直接测序,测序结果与已知参考毒株进行序列比对及系统进化分析.结果对阳性样本病毒HA基因测序获得6份HA序列,均分布在进化分支2.3.2的Ⅱ-1分支下.广西的6序列无论是氨基酸还是核苷酸的都是高度同源的,其核苷酸同源性在99.5%~100%,氨基酸同源性在99.5%~99.8%;序列测定的结果同时表明无论是受体特异性还是连接肽都是禽源的.结论2011年广西农贸市场流行的禽流感H5N1亚型病毒主要以进化分支2.3.2Ⅱ-1为主,均为禽源性的病毒.
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关 键 词: | 禽流感病毒 H5N1亚型 血凝素 |
Sequence analysis of hemagglutinin gene of avian influenza H5N1 virus in Guangxi |
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Abstract: | |
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Keywords: | Avian influenza virus H5N1 subtype Hemagglutinin |
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