人TERT基因启动子区生物信息学分析 |
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引用本文: | 夏得淳,雷子贤,赵娟,李婷婷,赵娟.人TERT基因启动子区生物信息学分析[J].肿瘤预防与治疗,2020,33(3):215-223. |
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作者姓名: | 夏得淳 雷子贤 赵娟 李婷婷 赵娟 |
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作者单位: | 832000 新疆 石河子,石河子大学 医学院;830001 乌鲁木齐,新疆维吾尔自治区人民医院 皮肤性病科 |
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基金项目: | 新疆维吾尔自治区自然科学基金 |
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摘 要: | 目的:探讨人端粒酶逆转录酶基因启动子区的序列特征、转录因子及其结合位点。方法:从NCBI数据库中获取人TERT基因组序列及其启动子序列:利用EMBOSS 6.6.0、CpGfinder 1.0和MethPrimer 1.0软件预测启动子区CpG岛的位置;利用Patch 1.0和PROMO 3.0.2软件预测可与TERT基因结合的潜在转录因子及结合位点。结果:TERT基因定位于5q 13.33,基因序列全长共41 881bp,其启动子位于TERT基因5`端上游2500bp处,全长2043bp。TERT基因启动子区可能存在2个CpG岛和118个转录因子。结论:通过生物信息学软件对hTERT基因启动子进行预测分析,可提高对hTERT基因启动子的研究效率,以便更加深入了解hTERT基因的调控机制及其生物学功能。
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关 键 词: | 人TERT基因 启动子 CpG岛 转录因子 |
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