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基于生物信息学数据分析ELTD1 在肾透明细胞癌组织中的表达、甲基 化水平及其临床意义
引用本文:黄逸婷,王珂,方晨.基于生物信息学数据分析ELTD1 在肾透明细胞癌组织中的表达、甲基 化水平及其临床意义[J].中国肿瘤生物治疗杂志,2022,29(12):1115-1124.
作者姓名:黄逸婷  王珂  方晨
作者单位:1. 苏州大学附属第二医院 临床营养科,江苏 苏州 215004;2. 南京医科大学附属苏州 医院泌尿外科,江苏 苏州 215004
基金项目:国家自然科学基金资助项目(No.82070814)
摘    要:目的:探讨表皮生长因子蛛毒素受体7 穿膜结构域蛋白1(ELTD1)在肾透明细胞癌(ccRCC)组织中的表达、甲基化水 平及其与患者临床病理特征和预后的相关性。方法:通过公共数据库分析ccRCC 组织中ELTD1 表达和甲基化的差异水平,探讨 ELTD1 表达水平与患者临床病理特征和预后的相关性。通过TIMER2.0 数据库评估ccRCC 免疫细胞浸润,筛选ELTD1 相关免疫 检查点基因,进行GO 功能和KEGG 通路富集分析,通过基因共表达分析、筛选与ELTD1 相关的基因。结果:与癌旁组织比较,ELTD1 在ccRCC 组织中呈高表达(P<0.05)。TCGA-KIRC 队列中,ELTD1 的甲基化水平与其表达呈负相关(R=-0.37,P<0.01)。 ELTD1 转录表达在ccRCC 患者年龄、T 分期、M 分期、临床分期及病理分级组间存在显著差异(均P<0.01),且高表达ELTD1 与较 长的OS 和PFS 密切相关(HR=0.55、0.63,均P<0.01),ELTD1 高表达是ccRCC 的独立保护因素。ELTD1 表达与B 细胞、CD4+ T 细 胞、CD8+ T 细胞、巨噬细胞和嗜中性粒细胞的免疫浸润呈显著负相关(R=-0.16、-0.27、-0.25、-0.31、-0.27,均P<0.01)。GO 功能和 KEGG 通路富集分析结果显示,血管生成及肿瘤相关信号通路在ELTD1 高表达表型中显著富集(均P<0.01)。ELTD1 共表达基因 的生存分析提示,其肿瘤抑制作用与共表达网络有关。结论:ELTD1 在ccRCC 组织中高表达和低甲基化是患者预后良好的指标,且与免疫浸润相关。

关 键 词:肾透明细胞癌  表皮生长因子蛛毒素受体7  穿膜结构域蛋白1  甲基化  免疫浸润  预后标志物
收稿时间:2022/7/30 0:00:00
修稿时间:2022/11/6 0:00:00

Analysis of expression, methylation, and clinical significance of ELTD1 in clear cell renal cell carcinoma based on bioinformatics
HUANG Yiting,WANG Ke,FANG Chen.Analysis of expression, methylation, and clinical significance of ELTD1 in clear cell renal cell carcinoma based on bioinformatics[J].Chinese Journal of Cancer Biotherapy,2022,29(12):1115-1124.
Authors:HUANG Yiting  WANG Ke  FANG Chen
Institution:1. Department of Clinical Nutrition, the Second Affiliated Hospital of Soochow University, Suzhou 215004, Jiangsu, China; 2. Department of Urologyical Surgery, Suzhou Hospital Affiliated to Nanjing Medical University, Suzhou 215004, Jiangsu, China
Abstract:
Keywords:clear cell renal cell carcinoma (ccRCC)  epidermal growth factor  latrophilin and seven transmembrane domain-containing 1 (ELTD1)  methylation  immune infiltration  prognostic marker
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