Snail 基因mRNA 与结肠癌患者预后的生物信息学分析

目的:探讨Snail 在结直肠癌中的表达及其与患者预后的关系。方法:应用生物信息分析工具比对TCGA 数据库中Snail 基因mRNA 在结直肠癌组织和癌旁组织中的表达水平；在STRING 数据库中构建Snail 蛋白- 蛋白相互作用网络，并对相关蛋白功能和KEGG 信号通路进行富集。同时，回顾性分析我院69 例手术治疗的结直肠癌患者资料，根据Snail 表达水平分为高、低表达组，比较两组患者总生存期(OS)和无疾病进展生存期(DFS)的差异。采用免疫组织化学法检测患者癌组织中Snail 蛋白表达水平及其与患者临床病理特征的关系。结果:结直肠癌组织Snail 基因mRNA 表达水平明显高于癌旁组织；PDGFB 基因与Snail 呈正相关(r =0.624, P <0.05)，SLC44A4 基因与Snail 呈负相关(r = – 0.48, P <0.05)。Snail 基因在生物学过程、细胞成分和分子功能方面分别富集于组蛋白H4 脱乙酰化、ESC/E(Z)复合体和NAD 依赖性组蛋白脱乙酰酶活性(H3-K14 特异性)。KEGG 信号通路富集于肿瘤相关信号通路、Notch 信号通路、Wnt 信号通路和结直肠癌相关信号通路等。生存分析显示，Snail 高表达患者的OS 低于低表达患者(HR=1.6, P <0.05)，而Snail 高、低表达患者的DFS 差异无统计学意义(P >0.05)。Snail 蛋白在结肠癌组织中的表达率为59.2%(41/69)。Snail 蛋白高表达者在肿瘤分化程度、淋巴结转移、淋巴管侵犯率、Dukes 分期等方面均差于低表达者，差异有统计学意义。结论:Snail 基因在结直肠癌患者癌组织中表达水平上调，并可作为结直肠癌预后不良的分子标志物。

Expression of Snail in Colorectal Cancer, Related Signal Pathway and its Relationship with Prognosis