长链非编码RNA基因芯片技术筛选口腔扁平苔藓唾液外泌体差异表达基因

目的研究利用基因芯片技术筛选长链非编码RNA（lncRNA）和信使RNA（mRNA）在口腔扁平苔藓（OLP）唾液外泌体中的异常表达，分析和探讨lncRNA和mRNA在OLP发生、发展中可能的分子机制。 方法收集9例OLP患者和3名健康对照者的唾液样本，分离得到样本中的外泌体。对外泌体进行纳米颗粒跟踪分析（NTA）检测、透射电子显微镜检测和外泌体特异性生物标志物的蛋白免疫印迹法（Western blot）鉴定。使用lncRNA基因表达芯片技术比较糜烂型OLP患者（EOLP组）和网纹型OLP患者（ROLP组）与健康对照者唾液外泌体中lncRNA和mRNA的表达谱，筛选得到差异表达基因并进行基因本体（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析。 结果NTA、透射电子显微镜和Western blot检测均证实分离得到外泌体。唾液外泌体lncRNA基因表达芯片结果显示，与对照组相比，EOLP组中有267个差异表达的lncRNA，其中上调99个、下调168个；有122个差异表达的mRNA，其中上调38个、下调84个；ROLP组中有201个差异表达的lncRNA，其中上调83个、下调118个；有86个差异表达的mRNA，其中上调32个、下调54个。两组有50个相同的差异表达mRNA和128个相同的差异表达lncRNA。GO和KEGG分析显示，差异表达基因涉及到基因转录、蛋白翻译和免疫反应等多个生物学过程。 结论本研究确定了OLP患者唾液外泌体中lncRNA和mRNA的表达谱，筛选出了与OLP相关的差异表达lncRNA和mRNA，可作为诊断和阐明OLP发病机制的重要候选者。

Screening differentially expressed genes in salivary exosomes of oral lichen planus by lncRNA microarray