| 食管鳞状细胞癌患者血清全基因组microRNA测序和分析 |
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| 引用本文： | 张燕妮,李艳芳,王成,管晓翠,陈熹,曾科,张辰宇,张春妮.食管鳞状细胞癌患者血清全基因组microRNA测序和分析[J].临床检验杂志,2012,30(9):641-644. |
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| 作者姓名： | 张燕妮 李艳芳 王成 管晓翠 陈熹 曾科 张辰宇 张春妮 |
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| 作者单位： | 徐州市肿瘤医院肿瘤内科，江苏徐州221000;徐州市肿瘤医院肿瘤内科，江苏徐州221000;南京军区南京总医院检验科，南京210002/南京大学生命科学学院医药生物技术国家重点实验室，南京210002;南京军区南京总医院检验科，南京210002;南京大学生命科学学院医药生物技术国家重点实验室，南京210002;南京大学生命科学学院医药生物技术国家重点实验室，南京210002;南京大学生命科学学院医药生物技术国家重点实验室，南京210002;南京军区南京总医院检验科，南京210002 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(81171661)。 |
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| 摘 要： | 目的通过测序、分析食管鳞状细胞癌(ESCC)患者血清全基因组微小核糖核酸(miRNA)表达谱,筛选出表达上调的miRNA,探讨其作为ESCC分子标志物的可能性。方法收集未经治疗的199例ESCC患者血清,同时以107例年龄、性别匹配的健康人血清作对照。用Solexa测序技术对血清miRNA进行测序和表达量测定,用实时荧光定量PCR技术对表达上调的miR-223验证,并与血清CEA含量比较。结果 Solexa测序结果显示,ESCC患者和健康人混合血清小分子RNA中miRNA含量所占比例分别是75.46%和81.44%,22种miRNA在患者血清中表达量是健康人对照的2倍以上;PCR分析证实,miR-223在患者血清中的浓度M(P25,P75)]显著高于健康人对照893.8(684.8,1 200.7)fmol/L vs 445.6(347.7,664.0)fmol/L,t=10.03,P<0.01];用于ESCC诊断的miR-223 ROC曲线下面积(AUCROC)为0.84(95%CI,0.79～0.89),明显大于CEA的0.55(95%CI,0.48～0.62),P<0.01;当cut off值为710.2 fmol/L时,miR-223诊断ESCC的敏感性和特异性分别为70%、80%;ESCC患者年龄、性别、病理类型、TNM分期、吸烟史、饮酒史与血清miR-223水平无明显相关性(P>0.05)。结论 ESCC患者血清miRNA表达谱与健康人存在差异,miR-223在患者血清中浓度显著升高,是ESCC潜在的分子标志物。
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| 关 键 词： | 食管鳞状细胞癌 血清微小核糖核酸 Solexa测序 实时荧光定量PCR |
| 收稿时间： | 6/3/2012 12:00:00 AM |
| 修稿时间： | 2012/7/30 0:00:00 |
Sequencing and identification of microRNAs from a genome wide expression profile in serum of esophageal squamous cell carcinoma |
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| ZHANG Yan-ni,LI Yan-fang,WANG Cheng,GUAN Xiao-cui,CHEN Xi,ZENG Ke,ZHANG Chen-Yu,ZHANG Chun-ni.Sequencing and identification of microRNAs from a genome wide expression profile in serum of esophageal squamous cell carcinoma[J].Chinese Journal of Clinical Laboratory Science,2012,30(9):641-644. |
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| Authors: | ZHANG Yan-ni LI Yan-fang WANG Cheng GUAN Xiao-cui CHEN Xi ZENG Ke ZHANG Chen-Yu ZHANG Chun-ni |
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| Institution: | 1.Department of Medical Oncology,Cancer Hospital of Xuzhou,Xuzhou 221000,Jiangsu;2.Department of Clinical Laboratory,Nanjing General Hospital of Nanjing Military Command,Nanjing 210002,Jiangsu;3.State Key Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology,School of Life Sciences,Nanjing University,Nanjing 210093,Jiangsu,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | esophageal squamous cell carcinoma serum microRNA Solexa sequencing RT qPCR |
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