自噬相关长链非编码RNA在肝细胞癌中的功能分析及预后模型构建 |
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引用本文: | 何莹,徐睿,扈晓宇.自噬相关长链非编码RNA在肝细胞癌中的功能分析及预后模型构建[J].中国免疫学杂志,2022,38(8):975-981. |
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作者姓名: | 何莹 徐睿 扈晓宇 |
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作者单位: | 成都中医药大学附属医院感染科 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(81973840); |
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摘 要: | 目的:筛选在肝细胞癌(HCC)中具有预后价值的核心自噬相关长链非编码RNA(lncRNA)。方法:选择癌症基因组图谱数据库(TCGA)和人类自噬数据库(HADb)进行生物信息学分析。以多因素Cox回归,最小绝对收缩和选择算子(Lasso)回归构建风险评分模型。模型的特异度和敏感度由受试者工作特征曲线(ROC)评估。相关生物学功能由Metascape数据库和基因集富集分析(GSEA)鉴定。结果:共鉴定了10个关键lncRNAs并据此构建风险评分模型。生存分析显示高风险组患者总生存期显著低于低风险组(P<0.001)。该模型在预测HCC患者一年、三年、五年生存率方面表现良好,曲线下面积分别是0.810、0.751、0.736。多因素Cox回归表明,该模型是HCC的独立预后因素(HR=3.666,P<0.001)。结论:本研究鉴定了10个自噬相关lncRNAs,并以之构建了1个用于HCC的预后风险模型,有望成为潜在的治疗靶点和新的预测指标。
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关 键 词: | 肝细胞癌 自噬 长链非编码RNA 计算生物学 预后 |
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