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| 湖北地区119例 HCV 1b 型 NS3丝氨酸蛋白酶区的序列变异研究 | |
| 引用本文： | 夏幼辰,潘雯,柯晓煜,王华,卢银平,郑昕,揭盛华,何生松,吴郡,杨东亮.湖北地区119例 HCV 1b 型 NS3丝氨酸蛋白酶区的序列变异研究[J].医学分子生物学杂志,2015(2). |
| 作者姓名： | 夏幼辰 潘雯 柯晓煜 王华 卢银平 郑昕 揭盛华 何生松 吴郡 杨东亮 |
| 作者单位： | 1. 华中科技大学同济医学院附属协和医院感染科 武汉市,430022 2. 华中科技大学同济医学院附属同济医院急诊科 武汉市,430030 3. 华中科技大学同济医学院附属协和医院感染免疫研究所 武汉市,430022 |
| 基金项目： | 国家传染病科技重大专项课题，科技部国际合作与交流专项，华中科技大学研究生创新创业基金(No. HF-11-30-2013)This work was supported by grants from the National Major Science and Technology Special Project for Infectious Diseases of China，International Science & Technology Cooperation Program of China，Gradu-ates'Innovation Fund of HUST |
| 摘 要： | 目的：分析丙型肝炎病毒(hepatitis C virus, HCV)1b 型非结构蛋白3(non-structure protein 3, NS3)丝氨酸蛋白酶区序列的变异规律及影响意义。方法使用基因型别特异性引物,通过巢式 PCR 的方法扩增119例慢性 HCV 1b 型患者血清中 HCV NS3区。对 PCR 产物进行测序后获得 NS3区核苷酸及氨基酸序列。分析119例 HCV 1b 型 NS3区序列的同源性及种系进化,分析 NS3丝氨酸蛋白酶区的变异情况及重要功能位点的突变情况。结果湖北地区 HCV 1b 型与 HCV 1b 型标准株及亚洲地区序列同源性较高,核苷酸序列同源性为85.94％及87.68％,氨基酸序列同源性可达96.83％及92.39％,而与欧美地区1b 型同源性较低,核苷酸序列同源性均为85.57％,氨基酸序列同源性分别为92.17％及93.38％。进化树分析提示湖北地区序列与中国其他地区序列亲缘性较接近,而与日本、东南亚地区及欧美地区的1b 型亲缘性较远。 NS3丝氨酸蛋白酶区185个氨基酸内有34个位点有氨基酸突变,但其重要的功能区包括催化酶底物特异性结合位点以及 Zn2﹢结合位点在所有序列中均高度保守,无一例发生突变。结论对湖北地区 HCV 1b型 NS3丝氨酸蛋白酶区的变异规律及生物学意义的研究进一步丰富和完善了对 HCV 1b 型基因组变异情况的认识。为了解 HCV1b 型在中国地区的进化过程提供一定理论基础。 |
| 关 键 词： | 丙型肝炎病毒 NS3 区 序列分析 |
Sequence Diversity of Hepatitis C Virus 1b NS3 Serine Protease Do-main in 119 Patients in Hubei Province of China |
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| XIA Youchen,PAN Wen,KE Xiaoyu,WANG Hua,LU Yinping,ZHENG Xin,JIE Shenghua,HE Shengsong,WU Jun,YANG Dongliang.Sequence Diversity of Hepatitis C Virus 1b NS3 Serine Protease Do-main in 119 Patients in Hubei Province of China[J].Journal of Medical Molecular Biology,2015(2). | |
| Authors: | XIA Youchen PAN Wen KE Xiaoyu WANG Hua LU Yinping ZHENG Xin JIE Shenghua HE Shengsong WU Jun YANG Dongliang |
| Abstract: | |
| Keywords: | hepatitis C virus NS3 sequence analysis |
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