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高通量测序分析人诱导性多能干细胞分化为神经干细胞后microRNAs的表达变化
引用本文:蔡皓然,叶国生,王青宁,陈露露,徐丽萍,龙大宏.高通量测序分析人诱导性多能干细胞分化为神经干细胞后microRNAs的表达变化[J].解剖学研究,2021,43(2):97-103.
作者姓名:蔡皓然  叶国生  王青宁  陈露露  徐丽萍  龙大宏
作者单位:广州医科大学基础医学院神经生物学重点实验室,广东广州511436
摘    要:目的 筛选出人诱导性多能干细胞(hiPSCs)分化为神经干细胞(NSCs)后差异表达的microRNAs,为采用microRNAs调节hiPSCs诱导分化为NSCs的实验研究提供依据.方法 采用添加TGF-β信号通路抑制剂的单层贴壁培养法,将hiPSCs向NSCs进行为期7 d的诱导分化,收集并提取未分化的hiPSCs及诱导第7天的hiPSCs源性NSCs的总RNA,进行microRNAs高通量测序,生物信息学分析法筛选出hiPSCs分化为hNSCs后差异表达的mi-croRNAs,qPCR验证microRNAs的差异表达结果.结果 经过为期7 d的神经方向诱导,hiPSCs能高比例的转化为巢蛋白Nestin阳性、底板细胞Foxa2阳性及PAX6阳性的神经干细胞,经microRNAs高通量测序差异表达分析发现:hiPSCs分化为NSCs后具有统计学差异表达的microRNAs有429个(P<0.05),具有显著差异表达的microRNAs有343个,其中表达上调的microRNAs有186个,下调的157个.与调节hiPSCs向NSCs分化的关键信号通路TGF-β进行相关性分析发现miR-1247-3P、miR-34b-5p及miR-210-5p等20余个差异表达的microRNAs.结论 抑制TGF-β信号通路可以促进hiPSCs向Nestin阳性的NSCs的诱导分化,分化后的NSCs的microRNAs表达谱较hiPSCs有明显差异,提示有望通过调节与TGF-β信号通路相关的microRNAs的表达促进hiPSCs向NSCs的诱导分化.

关 键 词:人诱导性多能干细胞  神经干细胞  微小RNA  诱导与分化

MicroRNAs expression changes after differentiation of human induced pluripotent stem cells into neural stem cells using high-throughput sequencing
CAI Hao-ran,YE Guo-sheng,WANG Qing-ning,CHEN Lu-lu,XU Li-ping,LONG Da-hong.MicroRNAs expression changes after differentiation of human induced pluripotent stem cells into neural stem cells using high-throughput sequencing[J].Anatomy Research,2021,43(2):97-103.
Authors:CAI Hao-ran  YE Guo-sheng  WANG Qing-ning  CHEN Lu-lu  XU Li-ping  LONG Da-hong
Abstract:
Keywords:
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