肺腺癌预后代谢相关基因的生物信息学分析 |
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引用本文: | 张文婷,刘亚锋,胡春晓,王雪芹,谢军,张雪,胡万发,吴静,邢应如,胡东.肺腺癌预后代谢相关基因的生物信息学分析[J].细胞与分子免疫学杂志,2023(1):41-48. |
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作者姓名: | 张文婷 刘亚锋 胡春晓 王雪芹 谢军 张雪 胡万发 吴静 邢应如 胡东 |
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作者单位: | 1. 安徽理工大学医学院;2. 安徽理工大学附属肿瘤医院检验科;3. 安徽省职业健康安全工程实验室;4. 安徽工业粉尘深度净化与职业健康教育部重点实验室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(81971483);;淮南市科技基金项目(2018A367); |
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摘 要: | 目的 基于代谢基因的生物信息学构建肺腺癌预后模型及验证。方法 获取癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因表达数据集(GEO)肺腺癌相关数据,套索(LASSO)回归构建多基因预后模型并计算风险值(RS)。单因素、多因素Cox独立预后分析,通过受试者工作特征(ROC)曲线评价模型的ROC曲线下面积(AUC)并进行生存分析。构建列线图评价模型的可行性,通过基因集富集分析(GSEA)进行代谢基因功能富集分析。肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库分析患者RS与免疫细胞浸润以及与免疫检查点分子表达的相关性。结果 运用TCGA数据库基于18个代谢相关基因构建肺腺癌预后模型,RS可以作为独立的预后因子。ROC曲线下面积为0.713。生存分析显示,与高风险组相比,低风险组总体生存率更高,预后模型与免疫细胞的浸润以及与免疫检查点分子的表达有关。结论 代谢相关基因肺腺癌预后模型的RS是独立预后因子,模型具有较高的预后判断价值。
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关 键 词: | 肺腺癌 代谢基因 预后模型 生物信息学 |
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