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动脉型肺动脉高压分子标志基因的筛选与鉴定
引用本文:李洁,刘彩莹,严文文,沈玉芹,徐金媛,徐国彤,吕立夏,宋浩明.动脉型肺动脉高压分子标志基因的筛选与鉴定[J].中国病理生理杂志,2022(6):1063-1074.
作者姓名:李洁  刘彩莹  严文文  沈玉芹  徐金媛  徐国彤  吕立夏  宋浩明
作者单位:1. 同济大学附属同济医院心内科;2. 同济大学医学院生物化学与分子生物学系;3. 同济大学医学院药学院
基金项目:国家自然科学基金青年基金资助项目(No.81700316);
摘    要:目的:本研究旨在筛选和鉴定参与动脉型肺动脉高压(pulmonary arterial hypertension,PAH)发病的关键基因及相关信号通路,为进一步的转化医学研究提供新靶点。方法:从美国国立生物技术信息中心的GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中获取人GSE113439、GSE117261、GSE48149和GSE53408基因芯片数据集,经过数据筛选后确定PAH组103例和对照组56例进行比较分析。采用NetworkAnalyst软件筛选差异基因(differentially expressed genes,DEGs),Enrichr和Metascape进行基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因和基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析,STRING和Cytoscape建立蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络确定潜在的枢纽基因。采用野百合碱构建PAH大鼠模型,通过测量血液动力学参数与组织形态学观察造模是否成功...

关 键 词:动脉型肺动脉高压  生物信息学  炎症  细胞增殖
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