应用PFGE分析广州稻叶型霍乱弧菌的同源性 |
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引用本文: | 李孝权,庞杏林,张欣强,邓志爱,李美霞,陈守义,邓小玲,王鸣.应用PFGE分析广州稻叶型霍乱弧菌的同源性[J].广东寄生虫学会年报,2011(4):428-432. |
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作者姓名: | 李孝权 庞杏林 张欣强 邓志爱 李美霞 陈守义 邓小玲 王鸣 |
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作者单位: | [1]广州市疾病预防控制中心,广东广州510080 [2]广东省疾病预防控制中心,广东广州510600 |
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基金项目: | 广州市医药卫生科技项目(2009-YB-121); 广东省医学科研基金(A2010493) |
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摘 要: | 目的分析广州40株稻叶型霍乱弧菌的毒力基因和PFGE特征,探讨菌株的同源性和广州稻叶型霍乱弧菌流行的特点。方法应用PCR方法检测稻叶型菌株的4种毒力基因,采用限制性内切酶NotI对菌株进行PFGE分型,使用BioNumerics Version4.0软件(复选Dice相关系数和UPGMA方法)对菌株进行聚类和同源分析。结果绝大多数水型稻叶霍乱疫情相关菌株为genotypeA型菌,而绝大多数环境分离稻叶型霍乱弧菌为genotypeB型和C型菌。40株霍乱菌株分布于18种pulsotype,水型霍乱疫情相关菌株的pulsotype极为相近(相似性系数98%以上),而环境分离的稻叶型霍乱弧菌呈现明显的pulsotype多样性。结论是否携带ctxA基因是稻叶型霍乱弧菌人源分离株与环境分离株的主要区别之一,绝大多数环境分离的稻叶型霍乱弧菌与人源分离株的同源性较低,但仍需加强对不同来源菌株的同源性分析和溯源追踪。
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关 键 词: | 霍乱弧菌 毒力基因 脉冲场凝胶电泳分析(PFGE) 分子分型 同源性 |
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