C '散点图:一种描述氨基酸结构差异的新方法 |
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引用本文: | 唐鹤云,杨啸林,胡俊峰,张正国.C '散点图:一种描述氨基酸结构差异的新方法[J].中国生物医学工程学报,2011(5). |
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作者姓名: | 唐鹤云 杨啸林 胡俊峰 张正国 |
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作者单位: | 1. 徐州医学院医学影像学院,徐州221004;中国医学科学院基础医学研究所,北京协和医学院基础学院,北京100005 2. 中国医学科学院基础医学研究所,北京协和医学院基础学院,北京100005 3. 徐州医学院医学影像学院,徐州,221004 |
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基金项目: | 徐州医学院院长人才基金 |
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摘 要: | 研究氨基酸结构对蛋白质结构预测具有重要意义.目前主要采用二面角来描述氨基酸的几何结构,但是角度的方法比较抽象,并且难量化地评估结构差异的程度.提出一种描述氨基酸结构差异的新方法——C'散点图.这种方法用散点图的形式在三维坐标图上显示羧基碳原子C'的相对坐标,以描述氨基酸结构的多样性,比目前广泛使用的二面角方法更加直观,在分析多肽片段中氨基酸结构多样性方面具有较高的可视性和便利性.同时通过计算散点图上原子间的最远距离,该方法可望使量化衡量氨基酸结构差异性成为可能.C'散点图对进一步深化氨基酸结构分析具有重要意义.
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关 键 词: | 氨基酸几何结构 C'散点图 二面角 |
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