岗梅转录组及其乌索烷型三萜皂苷生物合成相关酶基因的发掘 |
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引用本文: | 郑夏生,罗秀秀,徐晖,詹若挺,陈蔚文.岗梅转录组及其乌索烷型三萜皂苷生物合成相关酶基因的发掘[J].世界科学技术-中医药现代化,2014,16(7):1505-1512. |
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作者姓名: | 郑夏生 罗秀秀 徐晖 詹若挺 陈蔚文 |
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作者单位: | 广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心/岭南中药资源教育部重点实验室 广州 510006;广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心/岭南中药资源教育部重点实验室 广州 510006;广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心/岭南中药资源教育部重点实验室 广州 510006;广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心/岭南中药资源教育部重点实验室 广州 510006;广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心/岭南中药资源教育部重点实验室 广州 510006 |
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基金项目: | 财政部中央财政支持地方高校发展专项资金项目(粤财教[2010]358 号):南药可持续利用研究与综合开发利用,负责人:陈蔚文;广东省科技厅广东省科技计划项目(2012A030100006):三九胃泰和感冒灵中岭南中药材规范化种植关键技术研究,负责人:韩正洲 |
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摘 要: | 目的:发掘与岗梅乌索烷型三萜皂苷生物合成相关的酶基因。方法:利用Illumina 测序平台对岗梅根进行转录组测序,通过基因注释、同源分析、系统发生分析等生物信息学手段,发掘可能参与合成的单基因簇(Unigenes)。结果:在岗梅根转录组中发现了272 条与萜类生物合成相关的Unigenes。这其中包括72 条可能参与萜类生物合成上游途径的Unigenes,以及26 条可能与三萜合成途径下游母核合成、氧化和糖基化相关的Unigenes。对其中部分Unigenes 进行系统发生分析,进一步揭示了这些Unigenes 与同源基因间的进化关系。利用酵母表达系统,鉴定了两个香树酯醇合酶IaAS1 和IaAS2,其中IaAS1 为少数以α-香树脂醇为主要产物的香树酯醇合酶之一。结论:本文从岗梅根转录组数据库中发掘到一系列可能与岗
梅乌索烷型三萜皂苷生物合成相关的酶基因。对这些基因的进一步研究,有助于从分子水平揭示岗梅中乌索烷型三萜皂苷的生物合成途径。
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关 键 词: | 岗梅 转录组 三萜皂苷 生物合成 基因发掘 |
收稿时间: | 2014/6/30 0:00:00 |
修稿时间: | 2014/7/12 0:00:00 |
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