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一个肝癌相关基因的生物信息学及其基因表达分析
作者姓名:於莉 韩泽广 黄健
作者单位:[1]华东理工大学生物工程学院,上海200237 [2]国家人类基因组南方研究中心,上海201203
摘    要:
筛选并克隆肝癌相关基因,探讨肝癌发病机制。方法:在国家人类基因组南方研究中心肝癌基因表达谱及其功能研究的工作基础上,发现1个未知功能基因(暂命名LLC基因),其DNA拷贝数在肝癌基因组中呈降低的趋势。本研究利用生物信息学和RT-PCR的方法,对其进行功能预测并在转录组水平检测该基因的表达。结果:LLC基因定位于染色体8p23.3区段,全长为6706bp,含有2个外显子,1个内含子,其开放阅读框长为1871bp,编码1个含有623个氨基酸的蛋白。该基因在67%(16/24)肝癌组织中呈现下调趋势。同时其在人体内多种组织均有表达。结论:LLC基因有可能是一个新的肝癌相关抑癌基因。

关 键 词:肝肿瘤/遗传学 基因表达 基因组 人 医学信息学 逆转录聚合酶链反应
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