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人MUC4氨基酸序列片段CDT_8~+细胞表位的多参数预测
引用本文:高文涛,徐泽宽,苗毅. 人MUC4氨基酸序列片段CDT_8~+细胞表位的多参数预测[J]. 南京医科大学学报(自然科学版), 2004, 0(6)
作者姓名:高文涛  徐泽宽  苗毅
作者单位:南京医科大学第一附属医院普外科 江苏南京210029(高文涛,徐泽宽),南京医科大学第一附属医院普外科 江苏南京210029(苗毅)
基金项目:南京医科大学科技发展基金项目(NY03031)
摘    要:
目的:预测人MUC4氨基酸序列(AAD53171)的CD8T细胞表位。方法:结合2种常用表位预测数据库和工具,应用多种参数和方法进行综合分析,包括主要组织相容抗原(MHC)结合力、蛋白酶体切割位点等综合预测方法。结果:得到HLA鄄A鄢0201的1(ATLLPVTSL)、145(ATPLPVTSL)和52(LPVTDASSV)3个可能表位,和HLA鄄A24的145(ATPLPVTSL)、1(ATLLPVTSL)两个可能表位。结论:本研究为应用合成肽抗原制备MUC4肿瘤疫苗提供了依据,提供了表位预测的可行方法。

关 键 词:肿瘤疫苗  MUC4氨基酸  T细胞表位  胰腺肿瘤

Multi-parameter Prediction of CD8+ T Cell Epitope for Human MUC4 Antigen
GAO Wen-tao,Xu Ze-kuan,MIAO Yi. Multi-parameter Prediction of CD8+ T Cell Epitope for Human MUC4 Antigen[J]. Acta Universitatis Medicinalis Nanjing, 2004, 0(6)
Authors:GAO Wen-tao  Xu Ze-kuan  MIAO Yi
Affiliation:GAO Wen-tao*,Xu Ze-kuan,MIAO Yi
Abstract:
Objective: To predict CD T cell epitope for human MUC4 antigen. Methods: To combined with 2 epitopeprediction database, to analyze with several parameter and method, including MHC binder and proteasome/immunoproteasome cutting site. Results: After comprehensive analysis, three HLA-A*0201 epitope were obtained: 1(ATLLPVTSL), 145(ATPLPVTSL) and 52(LPVTDASSV), two HLA-A24 epitope: 145(ATPLPVTSL) and 1(ATLLPVTSL). Conclusion: The multi-parameter epitope prediction method is feasible for T cell epitope prediction.
Keywords:tumor vaccine  MUC4  T cell epitope  pancreas tumor  
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