| 16S rDNA测序技术在婴儿肠道微生态研究中的应用 |
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| 引用本文： | 马丽亚,王辉林,陈睿,张敏,黄艳,卢光进.16S rDNA测序技术在婴儿肠道微生态研究中的应用[J].检验医学与临床,2015(2):166-168. |
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| 作者姓名： | 马丽亚 王辉林 陈睿 张敏 黄艳 卢光进 |
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| 作者单位： | 1. 深圳市宝安区妇幼保健院 新生儿科 518133
2. 深圳市宝安区妇幼保健院 中心实验室 518133 |
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| 基金项目： | 广东省深圳市科技计划项目(201102030)。 |
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| 摘 要： | 目的探讨16SrDNA测序技术在新生儿、婴儿肠道微生态研究中的应用。方法于生后3天、1月、6月、1岁时收集2例健康婴儿粪便标本共8份,提取细菌总DNA,以Illumina Hiseq 2000为测序平台,采用新一代高通量16SrDNA宏基因组测序技术对V6可变区测序,并进行生物信息分析(物种分类和丰度分析;多样性分析)。结果 8份样品共产生原始测序数据为1 027.47 Mbp,Unique tags序列数量均值为58630,OTU数量63~209;优势菌门为Proteobacteria和Firmicutes;在科水平,1%的物种1个月之内2~4种,6月后达7~10种;1号婴儿一直以Enterobacteriaceae占优势,2号婴儿优势菌群包括Enterobacteriaceae、Lachnospiraceae、Streptococcaceae和Bacteroidaceae;4个时间点的npShannon和Simpson指数分别为1.17、1.29、2.16、2.51和0.43、0.40、0.26、0.14。结论 16SrDNA测序技术能满足新生儿、婴儿肠道微生态研究需求;新生儿、婴儿粪便中含丰富细菌基因组;细菌物种丰度及分类存在个体差异;从出生到1岁,婴儿肠道菌群结构趋向复杂和多样。
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| 关 键 词： | 肠道菌群 测序 宏基因组 婴儿 |
Application of 16S rDNA sequencing technique in infantile intestinal microecological research |
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| MA Li-ya,WA NG Hui-lin,CHENRui
,
ZHANGMin,HUANGYan
,
LUGuang-jin.Application of 16S rDNA sequencing technique in infantile intestinal microecological research[J].Laboratory Medicine and Clinic,2015(2):166-168. |
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| Authors: | MA Li-ya WA NG Hui-lin CHENRui ZHANGMin HUANGYan LUGuang-jin |
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| Institution: | MA Li-ya;WANG Hui-lin;CHEN Rui;ZHANG Min;HUANG Yan;LU Guang-jin;Department of Neonatology;Shenzhen Bao′an District Maternal and Child Health Care Hospital;Central Laboratory,Shenzhen Bao′an District Maternal and Child Health Care Hospital; |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | intestinal microbiota sequencing metagenomics infant |
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