| 摘 要： | 目的：探究解旋酶样转录因子（helicase like transcription factor,HLTF）基因在肝细胞癌（hepatocellular carcinoma,HCC）中潜在的调控机制。方法：构建HLTF基因稳定敲除的HCC细胞株。应用RNA测序法（RNA sequencing,RNA-seq）检测并分析肝癌细胞HLTF基因敲除前后的差异表达基因。应用转座酶可及性染色质测序法（assay for transposase-accessible chromatin using sequencing,ATAC-seq）检测HLTF基因敲除前后肝癌细胞染色质可及性的改变。采用RNA-seq和ATAC-seq多组学数据进行联合分析,寻找HLTF基因潜在的下游调控通路和关键基因。结果：癌症基因组图谱（the cancer genome atlas,TCGA）数据库分析表明HLTF基因在HCC组织中的表达水平升高,且其高表达与HCC预后不良有关联;RNA-seq分析结果显示,与野生型肝癌细胞相比,HLTF基因敲除细胞中有563个基因的表达水平上调,656个基因的表达水平下调;ATAC-...
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