| 结直肠癌中LncRNA介导的内源性竞争性RNA调控网络 |
| |
| 引用本文： | 邓巧玲,柳家翠,喻明霞,李胜.结直肠癌中LncRNA介导的内源性竞争性RNA调控网络[J].西部医学,2020,32(2):166-170. |
| |
| 作者姓名： | 邓巧玲 柳家翠 喻明霞 李胜 |
| |
| 作者单位： | 武汉大学中南医院检验科,武汉大学中南医院检验科,武汉大学中南医院检验科,武汉大学中南医院生物样本库 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金(81472033；30901308)；湖北省自然科学基金(2013CFB233)；武汉大学珞珈青年学者科研基金(351人才计划)；武汉大学学位与研究生教育教学改革研究项目(2018)；2018年武汉大学医学部教学改革研究项目(2018058) |
| |
| 摘 要： | 【摘要】 目的 构建结直肠癌RNA调控网络，探讨结直肠癌中分子调控机制。方法 从TCGA数据库中提取结直肠癌转录水平表达数据，筛选差异表达RNAs,结合miRDB, miRcode, miRTarBase和TargetScan数据库靶基因预测 结果，整合LncRNA- miRNA.miRNA-mRNA关系对，基于ceRNA假说及LncRNA细胞内定位，筛选出胞质表达并介导该网络调控的LncRNA,重建结直肠癌中IncRNA-miRNA-mRNA作用网络。结果 在结直肠癌差异表达基因分析中初步筛选出119个LncRNA、32个m沢NA以及59个mRNA；识别777对LncRNA-miRNA与77对miRNA-mRNA, 基于ceRNA假说以及LncRNA在细胞内定位，最后筛选出15个上调LncRNA、3个下调miRNA(hsa-mir-145, hsa-mir- 193b, hsa-mir-150)以及5个上调mRNA重建ceRNA网络。结论 成功构建结直肠癌中LncRNA介导调控的ceRNA 网络，识别出预后相关的潜在靶点，为结直肠癌治疗研究提供了新的参考依据。
|
| 关 键 词： | 结直肠癌 TCGA 肿瘤标志物 内源性竞争性RNA |
Investigation of the endogenous competitive RNA regulatory network mediated by LncRNA in colorectal cancer |
| |
| DENG Qiaoling,LIU Jiacui,YU Mingxia and LI Sheng.Investigation of the endogenous competitive RNA regulatory network mediated by LncRNA in colorectal cancer[J].Medical Journal of West China,2020,32(2):166-170. |
| |
| Authors: | DENG Qiaoling LIU Jiacui YU Mingxia and LI Sheng |
| |
| Institution: | Department of Clinical Laboratory , Zhongnan Hospital, Wuhan University,Department of Clinical Laboratory , Zhongnan Hospital, Wuhan University,Department of Clinical Laboratory , Zhongnan Hospital, Wuhan University and BioBank, Zhongnan Hospital of Wuhan |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
|
| 点击此处可从《西部医学》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《西部医学》下载免费的PDF全文 |
|
