摘 要: | 目的 拟利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)方法筛选出与脓毒症发生、预后相关的关键基因,为今后的研究提供线索。方法 从基因表达(GEO)数据库中通过筛选数据集中样本数大于100,含有脓毒症患者和健康对照组,且有脓毒症患者预后情况数据集,筛选到了两个数据集GSE26378和GSE54514(下载时间:2020年12月28日),采用WGCNA方法对GSE54514数据集中163例脓毒症患者和健康对照组基因表达进行分析;筛选出与脓毒症发生和预后相关的核心靶基因并分析其功能。结果 GSE54514中男性64例,女性99例;平均年龄55.56岁(标准差17.21岁);GSE26378中平均年龄53.75岁(标准差3.21岁)。利用GSE54514数据集进行WGCNA算法筛选绿松色(TURQUOISE)模块作为核心模块,通过基因本体(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析提示TURQUOISE模块主要涉及RNA调控表达异常和RNA剪切组成等功能。通过对模块中基因深入分析,筛选出了固醇调节元件结合蛋白裂解激活蛋白(SCAP)可以作为核心靶基因。在内部数据集GSE54514中验证SCAP...
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