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亚洲地区丙型肝炎病毒基因重组研究
引用本文:张克英,周林源,杨晓江,张鸿雁,迟坤,张统一,尹敏红,邵中军. 亚洲地区丙型肝炎病毒基因重组研究[J]. 兰州大学学报(医学版), 2014, 40(4)
作者姓名:张克英  周林源  杨晓江  张鸿雁  迟坤  张统一  尹敏红  邵中军
作者单位:1. 第四军医大学学员旅,陕西西安,710032
2. 第四军医大学护理系,陕西西安,710032
3. 南京陆军指挥学院院务部门诊部,江苏南京,210045
4. 中国人民解放军95133部队医院,湖北武汉,430415
5. 中国人民解放军61886部队,新疆伊犁,835000
6. 兰州军区临潼疗养院第二疗养区,陕西临潼,710000
7. 兰州大学第二医院,甘肃兰州,730030
8. 第四军医大学军事预防医学系流行病学教研室,陕西西安,710032
摘    要:目的 检测亚洲地区丙型肝炎病毒(HCV)基因重组事件,探讨其重组规律及重组病毒株的分布情况.方法 收集GenBank中HCV病毒基因全序列1 192条,标记病毒分离地点并选出亚洲地区HCV序列296条,利用MEGA4.1软件对齐整理,参照参考序列去除空位.利用最大似然法构建进化树,划分HCV基因型,统计出亚洲地区HCV不同基因型的分布特征.运用RDP4.0软件检测HCV中的重组事件,统计基因型内与基因型间重组事件的发生规律.结果 1型为亚洲地区流行的主要基因型,共检测到重组序列22条.结论 不同基因型HCV在亚洲各地区分布有差异.基因重组断点在HCV基因组中散在分布,可能影响HCV病毒学特性与临床特征.

关 键 词:丙型肝炎病毒  基因  重组

The research of hepatitis c virus gene reorganization in Asia
Abstract:
Keywords:hepatitis C virus  genes  recombination
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