基于网络药理学与分子对接技术新疆阿魏抗癌作用机制探讨 |
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作者姓名: | 张敏 李莎妮 喻楷权 吴济丽 陈宇琪 杨建波 蔡伟 |
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作者单位: | 湖南医药学院 药学院, 湖南 怀化 418000;中国食品药品检定研究院 中药民族药检定所, 北京 100050;新疆维吾尔自治区药品检验研究院 国家药品监督管理局中药(维药)质量控制重点实验室, 新疆 乌鲁木齐 830054 |
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基金项目: | 湖南省科技创新计划资助项目(2022RC1228);湖南省教育厅资助科研项目(19A353) |
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摘 要: | 目的 采用网络药理学与分子对接技术探讨新疆阿魏Ferula sinkiangensisk抗癌的作用机制。方法 通过SymMap和SwissTargetPrediction 数据库筛选新疆阿魏的成分和靶点信息。利用 Genecards 数据库输入“cancer”关键词检索疾病的靶点;利用韦恩图获取药物-疾病的交集靶点,并借助STRING平台获取蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;利用DAVID数据库对药物-疾病的交集靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;利用Cytoscape 3.9.0软件绘制“活性成分-靶点-通路”网络图。利用 AutoDock软件对筛选出的主要活性成分及关键靶点进行分子对接实验,验证其结合活性。结果 获取新疆阿魏化学成分34个,对应靶点537个,通过筛选获得癌症靶点1 155个,药物-疾病的交集靶点134个。GO功能富集分析共获取331条条目(P<0.05),其中生物过程(BP)249条,细胞组成(CC)31条,分子功能(MF)51条。KEGG通路 133条,并建立活性成分-靶点-通路网络,分子对接实验表明活性物质阿魏酸、法尼斯淝醇 A、法尼斯淝醇 C、柠檬烯和 β -蒎烯与关键靶点 CCND1、JUN、CXCL8、PIK3CA 均具有较好的结合能 力 。 结论 新疆阿魏中阿魏酸、法尼斯淝醇 A、法尼斯淝醇 C、柠檬烯和 β-蒎烯等化学物质,通过 CCND1、JUN、CXCL8和PIK3CA等靶点,调节PDL-1表达和PD-1免疫检查点通路、IL-17信号通路、雌激素信号通路和PI3K-Akt信号通路等发挥抗癌作用。
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关 键 词: | 新疆阿魏 网络药理学 癌症 分子对接 阿魏酸 尼斯淝醇A 法尼斯淝醇C 柠檬烯 β-蒎烯 |
收稿时间: | 2022-11-06 |
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