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脂多糖结合蛋白的B细胞抗原表位预测及其效应初步分析
引用本文:冯起甲,徐智,吴国明,胡川闽,徐顺责,陈维中,郭芮伶. 脂多糖结合蛋白的B细胞抗原表位预测及其效应初步分析[J]. 第三军医大学学报, 2008, 30(4): 292-294
作者姓名:冯起甲  徐智  吴国明  胡川闽  徐顺责  陈维中  郭芮伶
作者单位:第三军医大学,新桥医院全军呼吸内科研究所,全军呼吸病研究重点实验室,重庆,400037;第三军医大学,医学检验系临床生物化学教研室,重庆,400038
摘    要:目的 预测人脂多糖结合蛋白(LBP)的B细胞抗原表位.方法 采用生物信息软件和互联网服务器,预测LBP的二级结构和分析LBP表面特性(亲水性、可塑性、可及性和抗原性),再计算平均抗原指数(AI),预测LBP的B细胞抗原表位.结果 LBP存在多个潜在的抗原表位,247~260序列(FKGEIFHRNHRSPV)的AI(0.040 7)明显高于其他片段,370~379序列(LPSSSKEPVF)和303~325序列(ITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFV)的AI分别是0.033 6和0.029 5.247~260序列是LBP潜在的B细胞优势抗原表位.结论 应用多参数预测到LBP的B细胞抗原表位.

关 键 词:LBP抗原  表位  B细胞  生物信息学
文章编号:1000-5404(2008)04-0292-03
收稿时间:2007-05-11
修稿时间:2007-09-26

Prediction of B-cell antigen epitope on lipopolysaccharide-binding protein
FENG Qi-jia,XU Zhi,WU Guo-ming,HU Chuan-min,XU Shun-gui,CHEN Wei-zhong,GUO Rui-ling. Prediction of B-cell antigen epitope on lipopolysaccharide-binding protein[J]. Acta Academiae Medicinae Militaris Tertiae, 2008, 30(4): 292-294
Authors:FENG Qi-jia  XU Zhi  WU Guo-ming  HU Chuan-min  XU Shun-gui  CHEN Wei-zhong  GUO Rui-ling
Abstract:
Keywords:LBP antigen    B cell   epitope    bioinformatics
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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