基于TCGA数据库的胃腺癌铜死亡相关lncRNA预后模型构建

目的基于癌症基因组图谱（TCGA）数据库建立胃腺癌的铜死亡相关长链非编码RNA（lncRNA）预后模型。方法从TCGA数据库中获取胃腺癌的转录组数据和临床数据，检索相关文献获取铜死亡相关基因，应用Pearson相关分析确定胃腺癌铜死亡相关lncRNA。对目标lncRNA进行单因素Cox和套索算法回归分析，筛选出预后相关lncRNA，然后对其进行多因素Cox回归分析，根据预后模型公式计算风险评分，将患者分成高、低风险组进行生存差异分析。通过Kaplan-Meier曲线、主成分分析、ROC曲线、列线图评价预后模型的预测效能。对高、低风险组进行肿瘤微环境（TME）、肿瘤突变负荷（TMB）、微卫星状态、免疫逃逸和药物敏感性分析。结果10个lncRNA被纳入构建预后模型，通过预后模型对样本进行生存分析发现，高风险组患者生存状况较差。主成分分析、ROC曲线证实该预后模型具有更高的灵敏度和准确度。单因素和多因素Cox回归分析显示年龄、临床分期和风险评分是预后的独立因子，以上述独立预后因子构建的列线图具有良好的区分度和一致性。进一步研究发现高风险组患者表现出更高的免疫浸润、低TMB、高度微卫星不稳定，并且高TMB和低风险的患者具有更好的预后。低风险组患者对更多的药物敏感，并且从免疫治疗中获益更多。结论铜死亡相关ln-cRNA构建的预后模型可预测胃腺癌患者的预后，同时可反映患者TME及免疫治疗获益情况，从而为胃腺癌患者的药物选择提供参考依据。