基于线粒体及铁死亡相关基因构建肾透明细胞癌预后模型及ACADSB的作用机制题录 |
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作者姓名: | 王君 邱强民 王天宇 郭嘉瑜 邱涛 周江桥 |
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作者单位: | 1.武汉大学人民医院器官移植科, 武汉 |
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摘 要: | 目的基于线粒体及铁死亡相关基因构建肾透明细胞癌(ccRCC)预后预测模型, 探讨与线粒体和铁死亡相关基因ACADSB在ccRCC预后中的价值。方法使用来自TCGA数据库的ccRCC的RNA测序数据和临床数据, 利用Wilcoxon检验获取ccRCC组织与正常组织差异表达的线粒体及铁死亡相关基因, 通过单因素Cox分析、最小绝对值收敛和选择算子(LASSO)分析和多因素Cox分析筛选与生存显著相关的基因并构建预后模型, 并评估预后模型在ccRCC中的预测能力。此外, 分析核心基因ACADSB在ccRCC中的表达水平、预后预测及生物学功能。在ccRCC细胞系中过表达ACADSB, 以研究其对ccRCC细胞体外增殖和迁移能力的影响。结果利用4个线粒体及铁死亡相关基因(GOT1、BID、ACADSB和PLA2G6)构建ccRCC风险评分预后模型MFrisk, 高风险评分组的患者的总生存期明显短于低风险组(P均<0.01)。模型预测患者1年、3年和5年生存率的受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)在训练集和测试集中分别为0.733、0.771、0.783和0.677、0.607、0.676。在训练集和测试集中, 单变量Cox分析及多变量Cox分析(P均<0.01)结果显示MFrisk评分与预后独立明显相关。且基于MFrisk和临床因素构建的列线图同样具有强大的预测性能。此外, 对关键基因ACADSB进行研究, 细胞计数试剂盒(CCK-8)实验、平板克隆形成实验、划痕愈合实验均证实过表达ACADSB抑制ccRCC细胞增殖和迁移能力。结论线粒体及铁死亡相关基因GOT1、BID、ACADSB、PLA2G6所构建预后模型可独立预测ccRCC预后;预后模型关键基因ACADSB过表达导致ccRCC细胞增殖和迁移能力下降, 为ccRCC治疗策略提供参考。
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关 键 词: | 肾透明细胞癌 线粒体 铁死亡 预后 生物信息学 |
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