| MSMEG＿6171在耻垢分枝杆菌中的表达及多组学关联分析 |
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| 引用本文： | 谭秋婵,魏文静,陈珣珣,张晨晨,赵雨川,巫株华. MSMEG＿6171在耻垢分枝杆菌中的表达及多组学关联分析[J]. 中国人兽共患病杂志, 2022, 38(11): 982-987. DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2022.00.141 |
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| 作者姓名： | 谭秋婵 魏文静 陈珣珣 张晨晨 赵雨川 巫株华 |
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| 作者单位： | 1.广州卫生职业技术学院生理学教研室,广州 510450;2.广东省结核病控制中心结核病研究所,广州 510630 |
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| 基金项目： | 广东省普通高校青年创新人才项目(No.2021KQNCX207)、广州市教育局高校科研项目(No.202032841)、广州市科技计划项目(No.202201011764). |
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| 摘 要： | 目的 筛选MSMEG＿6171在耻垢分枝杆菌中的可能调控通路或基因，并进行验证。方法 构建MSMEG＿6171基因过表达的耻垢分枝杆菌株和空载质粒对照菌株；对其转录组和蛋白质组进行验证并深入挖掘MSMEG＿6171过表达调控的下游信号网络；qRT-PCR验证差异表达基因。结果 成功构建了MSMGE＿6171过表达的耻垢分枝杆菌菌株(Msm::6171);转录组和蛋白质组数据的对比分析发现有38个基因在转录水平和蛋白表达水平显著上调，有31个基因表达水平显著下调；差异表达基因主要参与甘油酯代谢，核糖体和代谢通路；15个候选基因实时荧光定量PCR验证结果与转录组和蛋白质组测序分析趋势一致。结论 MSMGE＿6171调控了多个靶向基因，参与代谢和核糖体通路，为深入研究MSMGE＿6171的调控网络提供了新的认识和重要参考。
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| 关 键 词： | 耻垢分枝杆菌 MSMEG＿6171 多组学 调控网络 |
| 收稿时间： | 2022-03-07 |
Expression and multi-omics analysis of MSMEG_6171 in Mycobacterium smegmatis |
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| TAN Qiu-chan,WEI Wen-jing,CHEN Xun-xun,ZHANG Chen-chen,ZHAO Yu-chuang,WU Zhu-hua. Expression and multi-omics analysis of MSMEG_6171 in Mycobacterium smegmatis[J]. Chinese Journal of Zoonoses, 2022, 38(11): 982-987. DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2022.00.141 |
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| Authors: | TAN Qiu-chan WEI Wen-jing CHEN Xun-xun ZHANG Chen-chen ZHAO Yu-chuang WU Zhu-hua |
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| Affiliation: | 1. Guangzhou Health Science College, Guangzhou 510450, China;2. Center for Tuberculosis Control of Guangdong Province, Guangzhou 510630, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Mycobacterium smegmatis MSMEG_6171 multi-omics regulatory networks |
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