基于ITS2序列的中药材藤梨根DNA分子鉴定 |
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作者姓名: | 高婷 朱珣之 |
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作者单位: | 青岛农业大学生命科学学院 山东省高校植物生物技术重点实验室 青岛 266109,青岛农业大学生命科学学院 山东省高校植物生物技术重点实验室 青岛 266109;江苏科技大学生物技术学院 镇江 212018 |
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基金项目: | 山东省教育厅山东省高等学校科技计划项目(J14LE13):基于DNA条形码鉴定沙参属药用植物的关键技术研究,负责人:高婷;山东省自然基金委山东省自然科学基金高校联合专项资助项目(ZR2013HL021):基于DNA条形码的中药材桔梗分子鉴定研究,负责人:高婷;青岛市科技局青岛市应用基础研究计划项目(14-2-4-89-jch):北沙参转录组的高通量测序及香豆素合成关键酶的克隆研究,负责人:高婷。 |
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摘 要: | 目的:通过DNA条形码鉴定技术区分中药材藤梨根及其常见混伪品。方法:对采集的中药材藤梨根样品及其常见混伪品进行DNA 提取,PCR扩增和测序,运用CodonCode Aligner 3.5.7对所获ITS2序列进行拼接。应用MEGA 5.0软件计算藤梨根及其常见混伪品的Kimura 2-parameter(K2P)遗传距离,并构建NJ(邻接)系统聚类树,最后分析种间ITS2序列的二级结构差异。结果:中药材藤梨根两种基原植物的平均种内K2P遗传距离分别为0.001和0.002,远小于藤梨根与其常见混伪品之间的平均K2P遗传距离0.120;藤梨根与其常见混伪品的ITS2二级结构也存在明显差异;NJ树显示藤梨根的基原植物聚在一起,与混伪品可明显区分,但无法区别所有猕猴桃属植物。结论:ITS2序列可高效区分藤梨根及其常见混伪品,弥补了传统鉴定方法的不足,提高了鉴定效率及准确性。
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关 键 词: | 中华猕猴桃 DNA条形码 ITS2序列 分子鉴定 |
收稿时间: | 2015-11-29 |
修稿时间: | 2015-12-07 |
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