短翅豆芫菁beta-actin基因CDS区克隆与生物信息学分析 |
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引用本文: | 陈强,李品明,封孝兰,曾德军,罗舜,赵贵军,张承露,竭航.短翅豆芫菁beta-actin基因CDS区克隆与生物信息学分析[J].时珍国医国药,2018(2). |
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作者姓名: | 陈强 李品明 封孝兰 曾德军 罗舜 赵贵军 张承露 竭航 |
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作者单位: | 重庆市药物种植研究所;重庆市中药良种选育与评价工程技术研究分中心; |
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摘 要: | 目的克隆短翅豆芫菁beta-actin基因CDS区全序列,并进行生物信息学分析。方法使用PCR克隆技术和生物信息学分析方法。结果克隆得到该基因CDS区全序列,全长1131bp(Gen Bank序列号为KU884974),包含了ATG起始密码和TAA终止密码子,共编码了376个氨基酸,蛋白质分子量为93.37k Da,理论等电点为5.09。该基因蛋白均位于膜外,无跨膜结构,平均疏水性(GRAVY)为0.391,该组成蛋白结构稳定。进化树分析结果表明,短翅豆芫菁与中华豆芫菁,埃及伊蚊和鼎突多刺蚁亲缘较近。结论成功克隆、分析了短翅豆芫菁beta-actin基因CDS区序列,为深入研究该基因在短翅豆芫菁体内的表达调控及短翅豆芫菁遗传与进化关系提供理论基础。
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