王不留行种子的ITS2序列分子鉴定研究 |
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作者姓名: | 马双姣 周建国 金钺 赵菊润 姚辉 |
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作者单位: | 中国医学科学院 北京协和医学院 药用植物研究所 北京 100193,中国医学科学院 北京协和医学院 药用植物研究所 北京 100193,中国医学科学院 北京协和医学院 药用植物研究所 北京 100193,云南龙陵县石斛研究所 保山 678300,中国医学科学院 北京协和医学院 药用植物研究所 北京 100193 |
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基金项目: | 科学技术部国家科技支撑计划(2011BAI07B08):中药材质量评价体系建立及其质量标准示范研究子课题——中药种子种苗 DNA条形码鉴定及流通管理平台的建立,负责人:陈士林;科学技术部国家科技基础性工作专项(2014FY130400):长白山区药用植物资源考察与DNA条形码数据采集,负责人:孙超。 |
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摘 要: | 目的:基于ITS2序列对中药材王不留行种子及其混伪品进行鉴定研究,为王不留行种子及其混伪品的鉴定提供新方法。方法:对王不留行种子及其混伪品样品提取基因组DNA、PCR扩增、双向测序获得ITS2序列。应用MEGA 6.0软件计算种内、种间遗传距离,构建邻接树,基于自行编写的代码和开源代码 PHP QR Code的编码方式,将王不留行及其混伪品 ITS2序列转换为条形码图片,获得各物种二维DNA条形码图片,并在中药材DNA条形码鉴定系统(www.tcmbarcode.cn)对所获得ITS2序列进行分析鉴定。结果:王不留行药材ITS2序列长度为219-221bp,种内最大K2P遗传距离为0.009,小于其与混伪品的种间K2P遗传距离,王不留行及其混伪品ITS2序列间存在的变异位点较多。NJ树结果表明王不留行与其混伪品分别聚为一支,可明显区分。结论:ITS2序列可以准确鉴别王不留行种子,为其种质资源鉴定和中药材种子质量标准的建立提供了新方法,将获得的ITS2序列转换为二维DNA条形码可为王不留行药材流通管理提供便利,为保障王不留行临床用药安全提供了新的技术手段。
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关 键 词: | 王不留行 种子 ITS2鉴定 DNA条形码 混伪品 |
收稿时间: | 2015-06-16 |
修稿时间: | 2015-12-01 |
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