| 乳腺癌差异表达miRNA在预后中的意义 |
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| 引用本文： | 马跃,高英静,何浪.乳腺癌差异表达miRNA在预后中的意义[J].医学研究杂志,2018,47(1):39-44. |
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| 作者姓名： | 马跃 高英静 何浪 |
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| 作者单位： | 610500 成都医学院基础医学院,610500 成都医学院基础医学院,610500 成都医学院生物医学系 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目（81201702）；国家级创新性实验项目（201313705009） |
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| 摘 要： | 目的 运用生物信息学方法研究复发转移乳腺癌组织中的差异表达MicroRNAs，预测其在乳腺癌预后中的分子调控网络。方法 从GEO数据库中获取乳腺癌组织MiRNA表达谱，包括131例10年内无远处转移复发者，79例10年内有复发者。GEO2R在线分析工具筛选差异表达MiRNA，靶基因预测验证数据库预测miRNA靶基因，使用DAVID工具的基因功能注释和通路富集方法对靶基因进行分析。TF-miRNA调控数据库寻找其上游转录因子，Cytoscape软件构建互作网络。结果 复发转移组乳腺癌组织共筛选到差异表达的miRNA 5个，其中表达上调3个，表达下调2个。得到4个相关上游转录因子HIF1A、EGR1、FOXM1、ESR2，与差异miRNA共调控154个的靶基因。靶基因功能集中在BMP信号通路，TGF-β信号通路，细胞骨架组装功能和Rho GTPases信号通路。结论 差异性表达的miRNA包括hsa-miR-210、hsa-miR-33a、hsa-miR-32、hsa-miR-135a、hsa-miR-30a-3p，利用生物信息学方法，能够有效获取信息，为乳腺癌的治疗及预后监测的新策略研究开辟新思路。
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| 关 键 词： | 乳腺癌 预后 microRNAs 调控网络 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2017/2/10 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2017/4/3 0:00:00 |
Differential Expression of miRNA in Breast Cancer and the Significance in Prognosis |
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| Ma Yue,Gao Yingjing and He Lang.Differential Expression of miRNA in Breast Cancer and the Significance in Prognosis[J].Journal of Medical Research,2018,47(1):39-44. |
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| Authors: | Ma Yue Gao Yingjing and He Lang |
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| Institution: | Department of Biomedicine, Chengdu Medical College, Sichuan 610500, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Breast cancer Prognosis MicroRNAs Regulating network Bioinformatics |
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