基于生物信息大数据研究牡丹皮对自身免疫病“异病同治”作用机制及Q-marker预测 |
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作者姓名: | 唐加龙 张立超 |
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作者单位: | 上海中医药大学附属市中医医院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(81872880);;国家科技部“重大新药创制”科技重大专项(2018X09201008-002-071);;上海市科委科技创新行动计划(18401932700); |
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摘 要: | 目的 基于中医病机理论与系统药理学的方法探讨牡丹皮防治系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus, SLE)与类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis, RA)的“异病同治”功效网络和作用机制并对其Q-marker进行预测。方法 通过检索TCMSP、BATMAN、TCMID、ETCM、SymMap、中科院化学数据库等多个中药资源数据库结合中国知网文献挖掘建立牡丹皮化学成分库,利用ADME参数OB、DL值筛选活性成分。搜集TCMSP、BATMAN、TCMID数据库的活性成分靶点,STITCH、SIB、SEA数据库预测的活性成分靶点加以补充。Comparative toxicogenomics database(CTD)数据库收集SLE与RA相关靶点。根据韦恩图找出牡丹皮-SLE-RA共有靶点,构建蛋白互作网络,依据拓扑参数找出核心靶点。利用DAVID平台对共同交集靶点进行GO和KEGG分析,采用Cytoscape的插件ClueGO对共同核心靶点的GO-BP和KEGG分析结果进行可视化展示。基于“中药-成分-靶点-通路-疾病”网络分析预测Q-m...
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关 键 词: | 系统药理学 牡丹皮 SLE RA 异病同治 质量标志物 |
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