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人类白细胞抗原新等位基因B*54:09的序列分析
引用本文:章旭,蒋术一,李晓丰,张坤莲,陈阳,刘显智,李剑平. 人类白细胞抗原新等位基因B*54:09的序列分析[J]. 中华医学遗传学杂志, 2012, 29(1): 91-94
作者姓名:章旭  蒋术一  李晓丰  张坤莲  陈阳  刘显智  李剑平
作者单位:1. 辽宁省血液中心,沈阳,110044
2. 中国医科大学93期学生
摘    要:目的 鉴定1名中国人白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)新等位基因.方法 应用基于Luminex平台的聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(polymerase chain reaction-sequence specific oligonucleotide probes,PCR-SSOP)方法对先证者进行HLA基因分型、PCR产物测序和基因克隆DNA测序,通过软件分析该基因序列并与同源性最高的HLA等位基因比较序列差异.结果 PCR-SSOP基因分型显示先证者HLA-B位点反应格局异常,疑为HLA新等位基因.基因克隆后测序结果显示,其中1个等位基因为B*59:01,另一个等位基因序列与所有已知HLA等位基因不同,与同源性最高的HLA-B* 54:06基因序列相比,在第3外显子有6个核苷酸不同(nt486G→C、nt527A→T、nt538T→C、nt539G→T、nt559 C→A和nt560 T→C),导致了3个氨基酸改变,152位氨基酸由Glu→Val,156位氨基酸Trp→Leu和163位氨基酸Leu→Thr.结论 该等位基因为HLA新等位基因,被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B* 54:09.

关 键 词:人类白细胞抗原  新等位基因  序列分析

Identification and sequence analysis of a novel human leukocyte antigen allele B*54:09
ZHANG Xu , JIANG Shu-yi , LI Xiao-feng , ZHANG Kun-lian , CHEN Yang , LIU Xian-zhi , LI Jian-ping. Identification and sequence analysis of a novel human leukocyte antigen allele B*54:09[J]. Chinese journal of medical genetics, 2012, 29(1): 91-94
Authors:ZHANG Xu    JIANG Shu-yi    LI Xiao-feng    ZHANG Kun-lian    CHEN Yang    LIU Xian-zhi    LI Jian-ping
Affiliation:Liaoning Blood Center, Shenyang, Liaoning 110044, P. R. China. ljp_63@yahoo.com.
Abstract:
Keywords:Human leukocyte antigen  Novel allele  Sequence analysis
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