摘 要: | 目的 运用生物信息学及免疫信息学方法分析结核分枝杆菌(Mtb)Rv3203蛋白的结构特征,为研究Rv3203蛋白在Mtb感染中的功能提供基础。方法 利用信息学软件分别预测Rv3203蛋白的理化性质、溶解度、跨膜区、信号肽、亚细胞定位、糖基化位点、磷酸化位点、相互作用蛋白、免疫原性、抗原性、毒性、致敏性,以及T、B细胞抗原表位和二级结构,并对蛋白的三级结构进行建模,最后对Rv3203蛋白进行密码子优化、计算机克隆和构建进化树。结果 Rv3203蛋白由224个氨基酸组成,理论等电点为4.68,为结构稳定的弱疏水性蛋白;无跨膜区和信号肽,定位于细胞质,具有1个糖基化位点和11个磷酸化位点;与lipD、lipE、lipP、lipZ、amiB2、amiC、bpoC、Rv0183、Rv1367c和Rv3204发生相互作用,参与Mtb的多种生物学过程;免疫原性为3.4211,抗原性为0.6533,无毒性,无致敏性;含5个CTL表位、1个Th表位和4个B细胞表位;二级结构和三级模型含大量的α-螺旋和无规则卷曲;经密码子优化后可在大肠杆菌中克隆并高效表达;此外,Mtb的Rv3203蛋白还与Mycobacterium canettii CIPT 140010059具有高度同源性。结论 Rv3203蛋白是一个结构稳定且具有热稳定性的酸性蛋白,具有免疫原性和抗原性,无毒性和致敏性,含多个T/B细胞表位,可在体外克隆并高效表达,参与Mtb的多种生物学过程及调控宿主的免疫应答反应。
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