幽门螺杆菌cagA基因3’端多态性分析及其临床意义

目的探讨幽门螺杆菌（H．pylon）eagA基因3’端多态性及其与临床疾病的相关性。方法收集NCBI网络数据库H．pylorieagA基因全序列95条，eagA基因3’端可变区碱基、氨基酸序列387条，用Vector NTI advance 10软件对已知疾病背景的256条网络数据库eagA氨基酸序列进行多序列比较，分析eagA基因3’端序列特征及其与临床疾病的相关性。结果（1）91条eagA基因全长氨基酸序列之间相同氨基酸百分比为27％，相似性较低；其3’端序列之间差异明显，存在大量氨基酸的插入、缺失、替换外和重复，而5’端序列相对保守。（2）eagA基因3’端氨基酸序列含有六种重复序列，分别命名为C1，C2，C3，C4，C5，C6；其中C3，C4，C6可分为两种类型，东亚型（Cn东）和西方型（Cn西）。大部分（81．86％）eagA基因3’端氨基酸序列基本结构为C1—C2-C1-C3东／C3西-C4东／C西-C5-C1-C6东／C6西。少数菌株eagA基因3’端氨基酸序列长度较长，具有不同的重复序列数目及组合方式，根据其重复序列数目及组合方式不同，可将这少数菌株eagA基因3’端氨基酸序列分为10型，其中1、7、9、10型仅存在于西方来源菌株，2、3、5、8型仅存在于东方来源菌株，4、6型为东西方菌株共有类型。（3）〉4个EPIYA模体的菌株检出率在萎缩性胃炎组（11．90％）与消化性溃疡（PU）组（1．27％）比较差异有统计学意义（P〈’0．05），且含有4个以上EPIYA模体的菌株87．5％是在萎缩性胃炎及胃癌（GU）中检出。含多个EPIYA—C／D位点的菌株在胃癌患者中的检出率（16．67％）显著高于消化性溃疡（5．06％）患者（P〈0．05）。c4数目=3时，GC组（14．81％）与Pu组（2．53％）比较差异有统计学意义（P〈0．05），其余重复序列数目在不同胃十二指肠疾病中无统计学意义（P〉0．05）。第6型菌株在胃癌患者中的检出率（14．81％）显著高于消化性溃疡（2．53％）患者（P〈0．05）。结论（1）且pylori菌株casA基因3’可变区多态性明显，其差异主要由重复序列的种类、数目和组合方式造成。（2）感染〉4个EPIYA模体的CagA＋H.pylori可能与萎缩性胃炎及胃癌有关。（3）含多个EPIYA—C／D位点的CagA＋H.pylori及第6型CagA＋H．pylori可能与胃癌有关。