摘 要: | 目的 探讨磷酸葡糖变位酶 2(PGM2)在脑胶质瘤中的表达及临床意义。方法 提取
中国胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)数据库和癌症基因组图谱计划(TCGA)数据库中脑胶质瘤患者的临
床数据和 mRNA 测序数据,将测序数据与临床数据相匹配后提取PGM2基因的表达情况,并剔除临床数
据缺失的病例。根据受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线获得的临界值(Cut-off值)
将病例分为PGM2高表达组和PGM2低表达组。采用 ROC 曲线下面积(AUC)和 Kaplan-Meier 生存曲线评
价PGM2表达水平对胶质瘤患者总生存率的预测价值。采用单因素分析影响PGM2表达水平的胶质瘤
临床病理因素。采用单因素、多因素 Cox 回归分析脑胶质瘤相关临床病理因素和PGM2表达与胶质瘤患
者预后的关系。通过筛选共表达基因,进行基因本体(GO)富集分析和 KEGG 通路分析,探讨PGM2参与
生物学过程以及调控的相关信号通路。采用 CIBERSORT 算法分析胶质瘤PGM2表达与免疫细胞浸润
的关系。结果 CGGA-325 数据库剔除缺失值后余 273 例,TCGA 数据库剔除缺失值后余 560 例。PGM2
表达量预测胶质瘤患者总生存率的 ROC 曲线分析显示,其在 CGGA-325 数据库中的AUC为 0.705(95%CI:
0.640~0.769),Cut-off 值为 10.1;在 TCGA 数据库中的AUC为 0.739(95%CI:0.699~0.778),Cut-off 值为
8.9。根据 Cut-off 值将病例分为PGM2高表达组和 PGM2 低表达组。Kaplan-Meier 生存分析显示,PGM2
高表达组患者的总生存率较PGM2低表达组患者下降,差异有统计学意义(P< 0.001)。CGGA-325 和
TCGA 数据库中,PGM2低表达与高表达组的胶质瘤级别、IDH分型以及 1p/19q 缺失情况比较,差异均有
统计学意义(均P< 0.05)。多因素 Cox 回归分析显示,CGGA-325 数据库与 TCGA 数据库中胶质瘤共同
独立预后因素是胶质瘤级别与1P/19q共缺失,PGM2表达在CGGA-325数据库中显示为独立预后因素(均
P< 0.05)。GO 富集分析和 KEGG 通路分析显示,PGM2表达与内质网蛋白转运、Toll 样受体信号通路以
及 I-κB 激酶 /NF-κB 信号通路相关。CIBERSORT 分析显示,PGM2低表达组与高表达组的初始 CD4+
T
细胞、活化的记忆 CD4+
T 细胞、调节性 T 细胞、单核细胞、巨噬细胞(M0、M1、M2)、中性粒细胞等的免疫
浸润程度比较,差异均有统计学意义(均P< 0.05)。结论 PGM2的高表达与胶质瘤较差的预后相关,
可能作为判断胶质瘤患者预后的指标,未来有望成为胶质瘤潜在的治疗靶点。
|