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基于生物信息学数据库探讨FOXO3基因在膀胱癌中的表达及临床意义
作者姓名:陶燕  李兰兰  卢建中  刘善辉  付生军  张静
作者单位:兰州大学第二医院, 甘肃省泌尿系统疾病研究重点实验室/甘肃省泌尿系临床医学中心, 甘肃 兰州 730030
基金项目:兰州大学第二医院“萃英科技创新”计划(CY2019-QN05)
摘    要:目的:探讨叉头转录蛋白O亚族3(FOXO3)基因在膀胱癌中的表达及临床意义。方法:利用GEPIA数据库分析FOXO3基因在膀胱癌与其癌旁正常组织中的表达情况,及其与患者预后的关系,利用UALCAN数据库分析膀胱癌中FOXO3表达与淋巴结转移的关系;通过TIMER数据库分析FOXO3基因表达与膀胱癌免疫浸润水平的相关性;通过String数据库分析与FOXO3相互作用的蛋白。结果:GEPIA数据库分析结果显示,FOXO3基因在膀胱癌组织中的表达显著低于癌旁正常组织(P < 0.01);低表达FOXO3基因的患者总生存率(OS)和无疾病生存率(DFS)均显著高于高表达者(P < 0.05)。UALCAN数据库分析结果显示膀胱癌中FOXO3的表达与淋巴结转移无明显相关。TIMER数据库分析显示FOXO3基因表达与B细胞(r=0.133,P < 0.05)、CD8+T细胞(r=0.262,P < 0.01)、CD4+T细胞(r=0.12,P < 0.05)、巨噬细胞(r=0.252,P < 0.01)、中性粒细胞(r=0.242,P < 0.01)和树突状细胞(r=0.162,P < 0.01)的免疫浸润水平呈正相关。蛋白相互作用网络分析发现,AKT1、SIRT1、EP300、BCL2L11、SOD2、SGK1、AKT2、CREBBP、CDKN1B、SMAD4等蛋白与FOXO3具有明显相互作用。结论:基于肿瘤基因数据库分析发现,FOXO3基因在膀胱癌组织中低表达,其高表达与患者预后不良相关;FOXO3表达与膀胱癌免疫细胞的浸润水平有关。

关 键 词:膀胱癌  FOXO3  数据库  表达  诊断  
收稿时间:2020-05-14
修稿时间:2020-07-06
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