| 基于生物信息学分析人TXNDC12基因在肝细胞癌的预后价值和作用机制 |
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| 作者姓名： | 杨彩婷 姜慧杰 王雨晴 来明名 陈艳 刘永新 王晓旋 |
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| 作者单位： | 1. 大理大学基础医学院;2. 中山大学孙逸仙纪念医院深汕中心医院病理科 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(81660465);;云南省应用基础研究计划项目(2014FD045); |
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| 摘 要： | 目的 探讨人硫氧还原蛋白结构域蛋白12(thioredoxin domain-containing 12,TXNDC12)基因在肝细胞癌中的表达情况、临床价值以及TXNDC12参与肝细胞癌发生、发展的机制。方法 基于TIMER2.0和GEPIA数据库分析TXNDC12在肝细胞癌组织和正常组织的表达差异;选用GEPIA数据库、TCGA数据库分析TXNDC12表达与肝细胞癌患者病理分期和生存预后的关系;选用Linked Omics数据库分析TXNDC12在TCGA-LIHC中共表达基因;进一步探究TXNDC12在肝细胞癌中发生、发展的上游调控机制,分析TCGA-LIHC中TXNDC12的甲基化探针与基因表达水平和患者临床预后的相关性。再选用TCGA-LIHC分析TXNDC12与免疫细胞的相关性。结果 生物信息学分析表明TXNDC12在肝细胞癌组织中的表达显著高于正常组织。随着肿瘤分期的进展,TXNDC12的表达量明显升高,在肝细胞癌患者中TXNDC12高表达患者总体生存期明显低于低表达患者,且预后模型具有显著的预测效果。与TXNDC12正相关的差异性表达基因有PPIH、MAGOH和BTF3...
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| 关 键 词： | 硫氧还原蛋白结构域蛋白12 肝细胞癌 预后标志物 甲基化 免疫浸润 |
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