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基于小鼠脾脏转录组测序探索脓毒症预后关键基因
作者姓名:罗福龙  张雨婷  余亚义  胡迎春  陈睦虎  钟武
作者单位:西南医科大学附属医院急诊科
摘    要:目的:运用脾脏高通量测序结合生物信息学筛选脓毒症死亡小鼠的关键差异表达基因(DEGs)。方法:(1)腹腔注射脂多糖(LPS)建立小鼠脓毒症模型,绘制7 d生存曲线确定生存组、死亡组造模剂量。(2)ELISA验证对照组、生存组、死亡组小鼠外周血浆TNF-α、IL-1β、IL-6、IL-10表达。(3)使用脓毒症生存组和死亡组脾脏测序,结合生物信息学分析DEGs,筛选关键基因。(4)RT-PCR及Western blot验证关键基因及蛋白表达差异。结果:(1)脓毒症生存组造模剂量为15 mg/kg LPS(死亡率为30%),死亡组造模剂量为30 mg/kg LPS(死亡率为80%)。(2)脓毒症小鼠外周血IL-6、TNF-α、IL-1β表达量较对照组明显升高,IL-10表达水平降低(P<0.05);脓毒症模型组间进行比较,死亡组促炎因子水平较生存组升高,IL-10较生存组降低(P<0.05)。(3)共筛选出生存组和死亡组中2 999个DEGs,其中1 185个基因上调,1 814个基因下调,筛选出“造血细胞谱系”“原发性免疫缺陷”“非洲锥虫病”“利什曼病”“B细胞受体信号通路”...

关 键 词:脓毒症  脾脏  转录组学  预后  关键基因
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