| 人大肠癌细胞PRL-3基因启动子Snail结合位点的初步研究 |
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| 引用本文： | 杨发达,李建明,周军,柳玉红,丁彦青.人大肠癌细胞PRL-3基因启动子Snail结合位点的初步研究[J].南方医科大学学报,2007,27(4):401-405. |
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| 作者姓名： | 杨发达 李建明 周军 柳玉红 丁彦青 |
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| 作者单位： | 南方医科大学南方医院病理科,南方医科大学基础医学院病理学教研室,广东省分子肿瘤病理重点实验室,教育部广东省共建人类重大疾病转录组学和蛋白组学重点实验室,广东,广州,510515 |
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| 摘 要： | 目的 确定转录因子Snail可与PRL-3基因启动子区结合.方法 应用生物信息学方法获得PRL-3基因启动子区域,并对其潜在的Snail结合位点进行预测,进一步应用Snail抗体染色质免疫共沉淀技术结合PCR技术检测PRL-3基因启动子序列,以确定转录因子Snail可与PRL-3基因启动子结合.结果 应用TRED在线分析系统确定PRL-3基因的启动子区域位于PRL-0基因上游-700 bp至299 bp之间,在该启动子区域存在多个转录因子如Snail、n-MYC、ARNT、E74A、NF-kappaB、NRF-2及AML-1等的结合位点;在启动子区域的-500 bp至-451 bp之间存在Snail结合的核心寡核苷酸序列CACCTG,在其他多个区域存在多个类似这一核心序列的DNA序列;应用染色质免疫沉淀技术结合PCR扩增的方法对人大肠癌细胞株SW480细胞进行分析,发现Snail可与人大肠癌细胞株SW480 PRL-3基因的启动子区域的DNA片断结合.结论 转录因子Snail可与人大肠癌细胞SW480 PRL-3基因启动子结合,参与PRL-3基因的调控.
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| 关 键 词： | 染色质免疫沉淀技术 Snail 启动子 PRL-3 |
| 文章编号： | 1673-4254（2007）04-0400-05 |
| 收稿时间： | 2006-10-24 |
| 修稿时间： | 2006年10月24 |
Preliminary study of PRL-3 gene promoter binding sites of Snail in SW480 cells |
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| YANG Fa-da,LI Jian-ming,ZHOU Jun,LIU Yu-hong,DING Yan-qing.Preliminary study of PRL-3 gene promoter binding sites of Snail in SW480 cells[J].Journal of Southern Medical University,2007,27(4):401-405. |
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| Authors: | YANG Fa-da LI Jian-ming ZHOU Jun LIU Yu-hong DING Yan-qing |
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| Institution: | Department of Pathology, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou 510515, China. |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | chromatin immunoprecipitation assay Snail promoter PRL-3 gene |
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