| 基于SNP位点鉴定藏菖蒲及其近缘种 |
| |
| 引用本文： | 王丽丽,林余霖,陈晓辰,廖保生,王晓玥,金钺,韩建萍.基于SNP位点鉴定藏菖蒲及其近缘种[J].中国现代中药,2014,16(11):895-900. |
| |
| 作者姓名： | 王丽丽 林余霖 陈晓辰 廖保生 王晓玥 金钺 韩建萍 |
| |
| 作者单位： | 中国医学科学院 北京协和医学院 药用植物研究所，北京100193;中国医学科学院 北京协和医学院 药用植物研究所，北京100193;中国医学科学院 北京协和医学院 药用植物研究所，北京100193;中国医学科学院 北京协和医学院 药用植物研究所，北京100193;中国医学科学院 北京协和医学院 药用植物研究所，北京100193;中国医学科学院 北京协和医学院 药用植物研究所，北京100193;中国医学科学院 北京协和医学院 药用植物研究所，北京100193 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目（81473303）；863计划（2012AA021602）：基于DNA条形码的珍稀药用、野生等资源快速检测技术及产品研发；太白贝母甾体生物碱生物合成途径的比较转录组学研究 |
| |
| 摘 要： | 目的：采用DNA条形码技术和SNPs技术，快速准确鉴定藏菖蒲及其近缘种、混伪品。方法：提取藏菖蒲及其近缘种的全基因组DNA，扩增内部第二转录间隔区（internal transcribed spacer 2，ITS2）并测序，测序结果用CodonCode Aligner 4.2.7拼接；基于隐马尔科夫模型（Hidden Markov Model，HMM）注释ITS2，采用MEGA5.1进行序列比对，SNP位点查找、种内主导变异分析和系统进化树构建。结果：通过对藏菖蒲同属近缘种的96条ITS2序列进行分析，发现第23位和212位存在稳定的SNP位点，可准确鉴定藏菖蒲；藏菖蒲ITS2序列的种内变异很小，仅在158位存在一个多拷贝位点。结论：该方法快速、准确、特异性强，可用于藏菖蒲的鉴定。
|
| 关 键 词： | 藏菖蒲 DNA条形码 鉴定 ITS2 SNPs |
| 收稿时间： | 2014/10/5 0:00:00 |
Molecular Authentication of the Oriental Medicine Acorus calamus Based on SNP Markers |
| |
| WANG Lili,LIN Yulin,CHEN Xiaochen,LIAO Baosheng,WANG Xiaoyue,JIN Yue and HAN Jianping.Molecular Authentication of the Oriental Medicine Acorus calamus Based on SNP Markers[J].Modern Chinese Medicine,2014,16(11):895-900. |
| |
| Authors: | WANG Lili LIN Yulin CHEN Xiaochen LIAO Baosheng WANG Xiaoyue JIN Yue and HAN Jianping |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
|
| 点击此处可从《中国现代中药》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《中国现代中药》下载免费的PDF全文 |
