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DNA损伤修复基因FANCI与肝癌预后和免疫浸润相关性
引用本文:游莹,梅美华,谭宁歆,陈怡丽,池沛冬,何晓顺,黄俊琪.DNA损伤修复基因FANCI与肝癌预后和免疫浸润相关性[J].中山大学学报(医学科学版),2023(1):51-62.
作者姓名:游莹  梅美华  谭宁歆  陈怡丽  池沛冬  何晓顺  黄俊琪
作者单位:1. 中山大学附属第一医院器官移植科//广东省器官捐献与移植免疫重点科实验室//广东省器官移植国际科技合作基地;2. 中山大学附属第一医院检验科;3. 中山大学肿瘤防治中心检验科
基金项目:国家自然科学基金(81871238);;广东省自然科学基金(2021A1515010435);;广州市科技计划项目(202103000007);
摘    要:【目的】探究DNA损伤修复基因FANCI在肝癌中的表达水平,及其与预后、临床分期、免疫浸润的关系。【方法】在本研究中,使用TCGA、GTEx、TIMER2.0及qRT-PCR法、蛋白质印迹法和免疫组织化学法研究FANCI在肝癌中的表达及其与不同临床分期之间的相关性;使用Kaplan-Meier Plotter数据库分析FANCI与肝癌预后的关系;使用TISIDB数据库探索FANCI与肝癌免疫细胞浸润及免疫检查点的关系;使用STRING数据库探索FANCI相结合的蛋白;使用TCGA及GTEx数据库进行GO及KEGG富集分析;通过细胞实验探索了FANCI在肝癌中的作用。【结果】与正常组织相比,肝癌组织FANCI的mRNA和蛋白表达水平上调(P<0.001);高表达FANCI的肝癌患者预后较差(P<0.001);肝癌组织中FANCI的表达与组织活化的CD4+T细胞数目、Th2细胞数目及免疫检查点基因的表达呈正相关,且FANCI高表达组的B细胞及巨噬细胞浸润水平明显较低(P<0.01);GO及KEGG富集分析显示FANCI相关基因富集在氨基酸跨膜转运体活性等多种生物过程中;细...

关 键 词:Fanconi贫血补充组Ⅰ  肝癌  免疫浸润  免疫检查点
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