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卡氏肺孢子虫kexin蛋白抗原表位预测
引用本文:朱丹丹,段义农,陈金铃. 卡氏肺孢子虫kexin蛋白抗原表位预测[J]. 现代预防医学, 2011, 38(6): 1077-1079
作者姓名:朱丹丹  段义农  陈金铃
作者单位:南通大学医学院人体寄生虫学教研室,南通,226001
基金项目:南通市应用研究计划资助
摘    要:[目的]预测卡氏肺孢子虫kexin蛋白的抗原表位。[方法]应用互联网服务器及相关生物软件预测卡氏肺孢子虫kexin蛋白抗原表位,进行生物信息学分析。[结果]kexin蛋白存在多个潜在的抗原表位,其中T细胞表位按积分位于第367~381,38~52,128~156,351~388,426~440位氨基酸等区域,B细胞表位位于第133~215,300~442及660~733位氨基酸区域。[结论]kexin抗原表位可能主要位于第38~215及300~442氨基酸序列区域内或其附近,抗原表位的预测可以有目的地克隆kexin重组基因片段,为研究高效卡氏肺孢子虫疫苗奠定基础。

关 键 词:卡氏肺孢子虫  kexin蛋白  抗原表位  生物信息学

PREDICTIONG ON the ANTIGENIC EPITOPES OF THE KEXIN PROTEIN FROM PNEUMOCYSTIS CARINII
ZHU Dan-dan,DUAN Yi-nong,CHEN Jin-ling. PREDICTIONG ON the ANTIGENIC EPITOPES OF THE KEXIN PROTEIN FROM PNEUMOCYSTIS CARINII[J]. Modern Preventive Medicine, 2011, 38(6): 1077-1079
Authors:ZHU Dan-dan  DUAN Yi-nong  CHEN Jin-ling
Affiliation:ZHU Dan-dan,DUAN Yi-nong,CHEN Jin-ling.(Department of Parasitology,School of Medicine,Nantong University,Nantong 226001,China)
Abstract:[Objective]To predict the epitopes of Pneumocystis carinii kexin protein.[Methods]By using the internet server and some software,we predicted the epitopes and analyze the bioinformatics of Pneumocystis carinii kexin protein.[Results]Multiple potential antigenic epitopes were predicted to be present in kexin protein of Pneumocystis carinii.Based on the prediction scores,the T cell epitopes were located at amino acid 367-381,38-52,128-156,351-388 and 426-440 residues,respectively,while the B cell epitopes wer...
Keywords:Pneumocystis carinii  Kexin protein  Epitope  Bioinformatics  
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