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| 申克孢子丝菌TPS基因生物信息学分析 | |
| 作者姓名： | 黄家敏 李玉哲 高文超 吴晓雁 孙瑶 黄丽林 张静 李美荣 胡南 旷翠娥 刘佳庆 黄怀球 |
| 作者单位： | 1.中山大学附属第三医院皮肤科510630;2.中山大学附属第三医院岭南医院检验科510630;3.广东省妇幼保健院儿科510010;4.中山大学孙逸仙纪念医院皮肤科510120;5.深圳市宝安区人民医院皮肤科518101;6.中山大学中山医学院510080; |
| 基金项目： | 国家自然科学基金面上项目(编号:81371746)；中山大学大学生创新训练计划项目(编号:201601072) |
| 摘 要： | 目的:分析和预测申克孢子丝菌海藻糖磷酸合成酶(TPS)基因及其编码蛋白的生物信息学特征及功能。方法:利用生物信息学软件和网站分析预测申克孢子丝菌TPS基因及其编码蛋白的结构和功能特征。结果:申克孢子丝菌TPS基因全长为2 864 bp,编码905个氨基酸。Target P和MotifScan预测该蛋白定位于胞浆中,具有糖基转移酶、海藻糖磷酸酶两大功能域及丰富的修饰位点,其中磷酸化位点尤为丰富,包含cAMP依赖性磷酸激酶、蛋白激酶C(PKC)和酪氨酸激酶(CK2)磷酸化位点。TPS蛋白是亲水性蛋白,无跨膜结构,未发现信号肽。结论:预测申克孢子丝菌TPS基因编码蛋白位于胞浆中,具有糖基转移酶、海藻糖磷酸酶两大功能域及丰富的修饰位点的结构功能特点,可行相应小分子抑制剂筛选以开发新型抗真菌药物。 |
| 关 键 词： | 申克孢子丝菌 海藻糖磷酸合成酶 生物信息学 |
| 本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录！ | |