| 黄花蒿bZIP转录因子基因家族及光调控表达模式分析＊ |
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| 引用本文： | 王星文,吴端,师玉华,张栋,丁丹丹,马婷玉,向丽.黄花蒿bZIP转录因子基因家族及光调控表达模式分析＊[J].世界科学技术-中医药现代化,2021,23(1):20-32. |
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| 作者姓名： | 王星文 吴端 师玉华 张栋 丁丹丹 马婷玉 向丽 |
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| 作者单位： | 中国中医科学院中药研究所/中药鉴定与安全性评估重点实验室 北京 100700;北京城市学院生物医药学部 北京 100083,中国中医科学院中药研究所/中药鉴定与安全性评估重点实验室 北京 100700;贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院,山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室,山地生态与农业生物工程协同创新中心 贵阳 550025,中国中医科学院中药研究所/中药鉴定与安全性评估重点实验室 北京 100700,中国中医科学院中药研究所/中药鉴定与安全性评估重点实验室 北京 100700,中国中医科学院中药研究所/中药鉴定与安全性评估重点实验室 北京 100700,中国中医科学院中药研究所/中药鉴定与安全性评估重点实验室 北京 100700,中国中医科学院中药研究所/中药鉴定与安全性评估重点实验室 北京 100700 |
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| 基金项目： | 国家卫生健康委医药卫生科技发展研究中心重大新药创制(2017ZX09101002-003-001):青蒿素优质原料高效制备及关键技术研究,负责人:向丽;国家卫生健康委医药卫生科技发展研究中心重大新药创制(2019ZX09201005-006-001):中药新药原料分子辅助育种关键技术,负责人:向丽;国家自然科学基金委员会联合基金项目(U1812403-1):特色药用植物资源适生性及保护研究,负责人:陈士林;国家留学基金管理委员会国家公派出国留学项目(201909110037):青蒿素合成路径关键酶转录调节研究,负责人:向丽。 |
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| 摘 要： | 目的碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)是青高素生物合成途径中的重要调控因子,本研究利用生物信息学手段鉴定黄花蒿全基因组bZIP转录因子家族成员并对其在光调控下表达模式进行分析,为进一步探索AabZIP转录因子功能及其对青蒿素合成途径的调控机制提供参考依据。方法以BLAST、Hmmsearch程序及Pfam数据库对黄花蒿基因组中bZIP基因进行筛选及鉴定,MAGA7.0软件、GSDS2.0、meme、ExPASy等在线工具对AabZIP家族进化关系、基因结构、保守结构域、蛋白理化性质等生物学信息进行分析,利用TBtools软件分析AabZIP基因在光调控下基因特征。结果全基因组水平上共鉴定出78条AabZIP家族成员,基于拟南芥分组将其分为10个亚族和1个未分组成员(AabZIP78),其中S亚族数量最多,有22条(28.2%);AabZIP基因结构较为保守,78条AabZIP基因中发现14组同源基因序列,其中13对受到纯化选择影响;除AabZIP78与番茄bZIP保守基序一致外,其余序列均与拟南芥bZIP保守基序一致;不同光照胁迫下基因表达水平存在较大差异,其中A、G、H及S亚族中大部分成员在蓝光胁迫下高表达。结论AabZIP响应光调控并参与复杂的青蒿素代谢途径,本研究可为进一步深入研究黄花蒿中bZIP转录因子基因进化、功能及光调控响应机制等奠定基础。
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| 关 键 词： | 黄花蒿 bZIP转录因子 光调控 表达分析 |
| 收稿时间： | 2020/4/19 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2021/3/2 0:00:00 |
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