2017-2018年浙江省湖州市急性胃肠炎病例GⅠ型诺如病毒感染状况及其基因型别特征

目的了解浙江省湖州市急性胃肠炎病例中GⅠ型诺如病毒的感染状况及基因型别特征。方法收集2017年4月至2018年6月湖州市2家哨点医院诊断为急性胃肠炎病例的粪便标本1 259份。采用实时荧光定量反转录–聚合酶链式反应(real time RT-PCR)对提取的病毒RNA进行GⅠ和GⅡ型诺如病毒核酸检测。采用RT-PCR对GⅠ型阳性标本进行RdRp区和VP1区部分片段的扩增和测序。综合在线分型工具和系统进化分析的结果判定病毒基因型别。结果诺如病毒核酸阳性171份,阳性率13.58%。GⅡ型和GⅠ型诺如病毒的检出阳性率分别为11.83%(149/1 259)和2.70%(34/1 259),GⅡ型诺如病毒为检出的主要型别。GⅠ型诺如病毒主要检出于2018年上半年。2018年2-6月各月GⅠ型诺如病毒的检出阳性率均大于监测期间GⅠ型的平均检出阳性率。基因分型结果显示,2018年检出的GⅠ型诺如病毒包括GⅠ.P4-GⅠ.5、GⅠ.P2-GⅠ.2、GⅠ.P1-GⅠ.1、GⅠ.Pd-GⅠ.3、GⅠ.P4-GⅠ.4、GⅠ.P2-GⅠ.5。其中GⅠ.P4-GⅠ.5、GⅠ.P2-GⅠ.5和GⅠ.Pd-GⅠ.3重组型诺如病毒首次在湖州市检出。结论湖州市流行的GⅠ型诺如病毒基因型别多样,重组现象明显。应加强GⅠ型诺如病毒在当地的分子流行病学监测,以及时发现新的变异或重组株。