|
|||||
|
|
| 胆固醇损伤内皮细胞差异表达基因的生物信息学分析 | |
| 引用本文： | 彭瑾瑜,朱勋,唐蔚青,王抒,黎健,王仁,郭芳,刘俊文,杨向东. 胆固醇损伤内皮细胞差异表达基因的生物信息学分析[J]. 中国动脉硬化杂志, 2005, 13(3): 259-262 |
| 作者姓名： | 彭瑾瑜 朱勋 唐蔚青 王抒 黎健 王仁 郭芳 刘俊文 杨向东 |
| 作者单位： | 1. 南华大学心血管病研究所,湖南省,衡阳市,421001 2. 北京医院卫生部老年医学研究所,北京市,100730 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金（3002103）;湖南省自然科学基金（02JJY4011）;湖南省教育厅青年基金（0211039） |
| 摘 要： | 目的利用差异表达基因克隆方法（抑制消减杂交）获得大量的动脉粥样硬化相关候选基因和表达序列标签后，探讨如何进行后续基因表达及功能的研究。方法利用Internet网络上的数据库及生物学分析软件对胆固醇损伤内皮细胞后获得的差异表达基因进行核酸序列和蛋白质序列分析，探索差异表达基因克隆后的研究方法和思路。结果通过电子延伸得到一个684bp的全长cDNA序列；通过核酸序列分析，该序列定位在线粒体基因组的7587位～8270位，含有一个完整的开放阅读框，编码与氧化磷酸化相关的9个亚基。对其中一个亚基细胞色素氧化酶Ⅱ（COX2）分析得知，细胞色素氧化酶Ⅱ基因编码一段25．6kDa的弱酸性的信号锚蛋白，细胞色素氧化酶Ⅱ蛋白的三维结构是一个典型的椅式结构，它含有一段疏水区域，一个跨膜结构域和一个胞质结构域。运用蛋白的进化分析，得知细胞色素氧化酶Ⅱ蛋白胞质结构域的氨基酸序列在进化过程中高度保守。结论生物信息学技术是一种高效的获取疾病相关基因信息的方法，利用生物信息学方法对细胞色素氧化酶Ⅱ基因进行分析，获得了基因及其编码蛋白的相关信息，该蛋白参与电子传递，可能与细胞的氧化应激有关。 |
| 关 键 词： | 病理学与病理生理学 胆固醇损伤内皮细胞差异表达基因的分析 生物信息学分析 动脉粥样硬化 内皮细胞 胆固醇 细胞色素氧化酶亚基Ⅱ |
| 文章编号： | 1007-3949（2005）13-03-0259-04 |
| 收稿时间： | 2004-06-24 |
| 修稿时间： | 2005-02-28 |
Bioinformatic Analysis of Differentially Displayed Gene in Human Endothelial Cell Induced by Cholesterol |
|
| PENG Jin-Yu,ZHU Xun,TANG Wei-Qing,WANG Shu,LI Jian,WANG Ren,GUO Fang,LIU Jun-Wen,and YANG Xiang-Dong. Bioinformatic Analysis of Differentially Displayed Gene in Human Endothelial Cell Induced by Cholesterol[J]. Chinese Journal of Arteriosclerosis, 2005, 13(3): 259-262 | |
| Authors: | PENG Jin-Yu ZHU Xun TANG Wei-Qing WANG Shu LI Jian WANG Ren GUO Fang LIU Jun-Wen and YANG Xiang-Dong |
| Affiliation: | Institute of ardiovascular Disease,Nanhua University,Hengyang 421001;1.Department of Biochemistry,Beijing Institute of Geriatrics,Beijing 100730,China |
| Abstract: | |
| Keywords: | |
| 本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录！ | |
| 点击此处可从《中国动脉硬化杂志》浏览原始摘要信息 | |
| 点击此处可从《中国动脉硬化杂志》下载全文 | |