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| p53基因沉默对HaCaT细胞MicroRNA表达谱的影响 | |
| 引用本文： | 任金平,王平,洪为松,韩飞,黎钊,倪亚杰.p53基因沉默对HaCaT细胞MicroRNA表达谱的影响[J].中华皮肤科杂志,2013,46(4). |
| 作者姓名： | 任金平 王平 洪为松 韩飞 黎钊 倪亚杰 |
| 作者单位： | 1. 浙江中医药大学附属杭州市第三人民医院皮肤科,杭州,310053 2. 杭州市第三人民医院皮肤科 3. 安徽医科大学杭州临床医学院 |
| 基金项目： | 浙江省自然科学基金，杭州市医学重点专科专病项目 |
| 摘 要： | 目的 研究p53基因沉默前后HaCaT细胞microRNA (miRNA)的差异表达谱并进行相关功能分析.方法 利用慢病毒介导的RNAi对培养的HaCaT细胞株进行p53基因沉默,通过Trizol法抽提细胞总RNA,PEG(聚乙二醇)方法分离miRNA,T4RNA连接酶荧光标记后进行miRNA芯片杂交,利用Genepix4000B图像分析软件和Genepix Pro 6.0软件进行数据分析,生物信息学方法检索出p53基因沉默前后HaCaT细胞差异表达的miRNA调控的靶基因,选取每个miRNA调控的前20个靶基因进行靶基因功能及KEGG分析.结果 p53基因沉默前后HaCaT细胞中发现53个差异表达的miRNA,其中41个表达上调,12个下调(差异＞2倍).上调超过200倍的miRNA有:hsa-miR-141-3p、hsa-miR-15a-5p、hsa-miR-27a-3p、hsa-miR-130b-3p、hsa-miR-19a-3p;下调超过75％的miRNA有:hiv1-miR-TAR-3p、hsa-miR-630、hsa-miR-1246、hsa-miR-1275.靶基因预测和靶基因KEGG分析结果显示,部分靶基因与MAPK信号通路、代谢通路、肿瘤侵袭等有关.结论 hsa-miR-141-3p等9个miRNA及其调控的靶基因可能参与p53的分子调控. |
| 关 键 词： | 基因 p53 角蛋白细胞 微RNAs 基因沉默 芯片分析技术 |
Effect of p53 gene silencing on microRNA expression profiles in HaCaT human keratinocytes |
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| REN Jin-ping , WANG Ping , HONG Wei-song , HAN Fei , LI Zhao , NI Ya-jie.Effect of p53 gene silencing on microRNA expression profiles in HaCaT human keratinocytes[J].Chinese Journal of Dermatology,2013,46(4). | |
| Authors: | REN Jin-ping WANG Ping HONG Wei-song HAN Fei LI Zhao NI Ya-jie |
| Abstract: | |
| Keywords: | Genes p53 Keratinocytes MicroRNAs Gene silencing Microchip analytical procedures |
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