| 中国和巴西临床新生隐球菌格鲁比变种菌株的种群和基因型比较分析 |
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| 引用本文： | 朱键,刘莹,大楠悦子,三上襄. 中国和巴西临床新生隐球菌格鲁比变种菌株的种群和基因型比较分析[J]. 第三军医大学学报, 2010, 32(3): 206-209 |
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| 作者姓名： | 朱键 刘莹 大楠悦子 三上襄 |
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| 作者单位： | 贵阳医学院附属医院消化内科,贵阳,550004;日本 千叶,日本千叶大学真菌医学研究中心 |
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| 基金项目： | 日本文部省资助项目(2008)~~ |
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| 摘 要： | 目的了解新生隐球菌格鲁比变种(Cryptococcus neoformans var.grubii)临床菌株在国内和巴西多位点微卫星位点定型(multilocus microsatellite typing MLMT)的种群分布特征,探讨并分析两国新生隐球菌格鲁比变种MLMT基因型差异。方法对已鉴定的69株新生隐球菌格鲁比变种进行DNA提取,采用3个微卫星位点(CNG1、CNG2、CNG3)的正反序列引物对相应的微卫星位点基因片段进行扩增后测序;测序后计算出每一菌株位点基序重复数(CNG1对应TA重复,CNG2对应GA重复,CNG3对应CAT重复);结合不同基序重复数判定各菌株的基因型。应用SPSS 11.5统计软件进行统计学分析。结果在33株被MLMT基因分型的国内新生隐球菌grubii变种菌株中有5种基因型被鉴定,其中29株为MLMT-17,占87.88%;而在36株巴西临床菌株中有10种基因型被鉴定,其中19株为MLMT-13,占52.78%。结论两国间新生隐球菌格鲁比变种临床菌株的主要基因型分布存在显著差异。巴西临床菌株的基因型分布表现为多样性。
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| 关 键 词： | 新生隐球菌变种格鲁比 临床菌株 多位点微卫星灶分型 |
Multilocus microsatellite typing of clinical Cryptococcus neoformans var.grubii strains from China and Brazil |
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| Zhu Jian,Liu Ying,Etsuko Ohkusu,Yuzuru Mikami. Multilocus microsatellite typing of clinical Cryptococcus neoformans var.grubii strains from China and Brazil[J]. Acta Academiae Medicinae Militaris Tertiae, 2010, 32(3): 206-209 |
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| Authors: | Zhu Jian Liu Ying Etsuko Ohkusu Yuzuru Mikami |
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| Abstract: | Objective To understand the genotype distribution of clinical Cryptococcus neoformans var.grubii strains from China and Brazil using multilocus microsatellite typing(MLMT) method and to study the difference in their MLMT genotyping.Methods DNA was extracted from the identified 69 clinical Cryptococcus neoformans var.grubii strains.DNA fragments covering microsatellite loci(CNG1,CNG2,and CNG3) were amplified by PCR and sequenced.The number of each motif repeats in 3 microsatellite regions(TA,GA,and CAT repea... |
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| Keywords: | Cryptococcus neoformans var.grubii clinical strains multilocus microsatellite typing |
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