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广州市2006年Ⅰ型登革病毒流行株E基因序列分析
引用本文:吴新伟,蒋力云,伍业健,罗雷,何丽娟,刘于飞,李向忠,王玉林. 广州市2006年Ⅰ型登革病毒流行株E基因序列分析[J]. 热带医学杂志, 2009, 9(5): 521-523,532
作者姓名:吴新伟  蒋力云  伍业健  罗雷  何丽娟  刘于飞  李向忠  王玉林
作者单位:广州市疾病预防控制中心,广州,510080;广州市疾病预防控制中心,广州,510080;广州市疾病预防控制中心,广州,510080;广州市疾病预防控制中心,广州,510080;广州市疾病预防控制中心,广州,510080;广州市疾病预防控制中心,广州,510080;广州市疾病预防控制中心,广州,510080;广州市疾病预防控制中心,广州,510080
基金项目:广东省科技计划项目(No.2008B030303041);;广州市科技计划项目(No.2006J1-C0141);;广州市医学科学技术研究重点项目(No.2006-ZDi-10)
摘    要:目的测定广州市2006年Ⅰ型登革病毒流行株的E基因序列并进行分析。方法收集广州市2006年登革热患者急性期血清,用C6/36细胞培养分离登革病毒,RT-PCR法扩增全长E基因,测定序列并绘制系统发生树,进行生物信息学分析。结果59份标本中38份病毒分离培养阳性,获得广州市2006年Ⅰ型登革病毒流行株GZ2006/1707的E基因序列,其同源性与东南亚缅甸、泰国、柬埔寨等地的流行株接近,但与广州市2002年Ⅰ型登革病毒流行株GZ2002/281较远。结论广州市2006年流行的登革病毒属输入性,但与2002年流行的登革病毒有不同的输入源。

关 键 词:登革病毒  E基因  序列测定  系统发生树

Analysis of E Gene of Type I Dengue Virus from the Outbreak in Guangzhou in 2006
WU Xin-wei,JIANG Li-yun,WU Ye-jian,LUO Lei,HE Li-juan,LIU Yu-fei,LI Xiang-zhong,WANG Yu-lin. Analysis of E Gene of Type I Dengue Virus from the Outbreak in Guangzhou in 2006[J]. Journal Of Tropical Medicine, 2009, 9(5): 521-523,532
Authors:WU Xin-wei  JIANG Li-yun  WU Ye-jian  LUO Lei  HE Li-juan  LIU Yu-fei  LI Xiang-zhong  WANG Yu-lin
Affiliation:Guangzhou Center for Disease Control and Prevention;Guangdong;Guangzhou 510080;China
Abstract:Objective To analyze the Envelope(E) gene of type I dengue virus from the outbreak in Guangzhou in 2006.Methods The sera were collected from local dengue fever patients during the outbreak,dengue virus was cultured and isolated by infecting C6 /36 cells.The full length E gene was amplified from the positive specimen by RT-PCR.The DNA sequences of the amplified E genes were analyzed DNAStar software.Results 38 strains were isolated from 59 samples.E gene of the represent strain GZ2006 /1707 was amplified.The...
Keywords:dengue virus  E gene  sequencing  phylogenetic tree  
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